1.
Haas-Neill, Liam ; Meneksedag-Erol, Deniz ; Chaudhry, Ayesha ; Novoselova, Masha ; Ashraf, Qirat F. ; de Araujo, Elvin D. ; Wilson, Derek J. ; Rauscher, Sarah ✉
The structural influence of the oncogenic driver mutation N642H in the STAT5B SH2 domain
PROTEIN SCIENCE 34 : 1 Paper: e70022 , 21 p. (2025)
DOI WoS Scopus PubMed
Közlemény:35903745 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35903745] [Egyeztetett]
2.
Chen, Lexin ; Roe, Daniel R. ; Kochert, Matthew ; Simmerling, Carlos ; Miranda-Quintana, Ramon Alain ✉
k-Means NANI: An Improved Clustering Algorithm for Molecular Dynamics Simulations
JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION 20 : 13 pp. 5583-5597. , 15 p. (2024)
DOI WoS Scopus PubMed
Közlemény:35336570 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35336570] [Egyeztetett]
3.
Chen, Lexin ; Mondal, Arup ; Perez, Alberto ✉ ; Miranda-Quintana, Ramon Alain ✉
Protein Retrieval via Integrative Molecular Ensembles (PRIME) through Extended Similarity Indices
JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION 20 : 14 pp. 6303-6315. , 13 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35336569 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35336569] [Egyeztetett]
4.
Ellin, Nicholas R. ; Guo, Yingchan ; Miranda-Quintana, Ramon Alain ✉ ; Prentice, Boone M. ✉
Extended similarity methods for efficient data mining in imaging mass spectrometry
Digital Discovery 3 : 4 pp. 805-817. , 13 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:34993544 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34993544] [Egyeztetett]
5.
Kadir, Fatin Filzah Nur Abdul ; Nordin, Muhamad Alif Che ; Shuid, Ahmad Naqib ; Omar, Mohammad Tasyriq Che ✉
Modified heated CGMD simulations for discovering stable docked conformations of BiTE antibody against CD3 and CD117/c-kit
MOLECULAR SIMULATION 50 : 14 pp. 1019-1038. , 20 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35371752 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35371752] [Egyeztetett]
6.
Khan, Mohd Imran ✉ ; Pathania, Sheetal ; Al-Rabia, Mohammed W. ; Ethayathulla, Abdul S. ; Khan, Mohammad Imran ; Allemailem, Khaled S. ; Azam, Mohd ; Hariprasad, Gururao ✉ ; Imran, Mohammad Azhar ✉
MolDy: molecular dynamics simulation made easy
BIOINFORMATICS 40 : 6 Paper: btae313 , 4 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35371753 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35371753] [Egyeztetett]
7.
Layek, S. ; Sengupta, N. ✉
Response of Foldable Protein Conformations to Non-Physiological Perturbations: Interplay of Thermal Factors and Confinement
CHEMPHYSCHEM: A EUROPEAN JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS AND PHYSICAL CHEMISTRY 25 : 23 Paper: e202400618 (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35620542 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35620542] [Nyilvános]
8.
Lopez-Perez, Kenneth ; Kim, Taewon D. ; Miranda-Quintana, Ramon Alain ✉
iSIM: instant similarity
Digital Discovery , 12 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:34993543 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34993543] [Egyeztetett]
9.
López Pérez, Kenneth ; Rácz, Anita* ✉ ; Bajusz, Dávid* ; Gonzalez, Camila ; Héberger, Károly ; Miranda‐Quintana, Ramón Alain
Alternative weighting schemes for fine‐tuned extended similarity indices
JOURNAL OF CHEMOMETRICS 38 : 9 Paper: e3558 , 10 p. (2024)
DOI WoS REAL Scopus
Zárolt Közlemény:34849934 Admin láttamozott Forrás Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34849934] [Admin láttamozott]
10.
Marufa, Sumita Saznin ; Rahman, Mohammad Mostafizur ✉ ; Rahman, Mizanur ; Jahan, Rownok ; Ara, Gulshan ; Nishino, Hiroshi ; Alam, Mohammad Sayed ✉ ; Haque, Md. Aminul ✉
Synthesis, Antimicrobial and Antioxidant Activity with in silico ADMET Prediction, Molecular Docking and Dynamics Studies of Carbazole Ring Containing Thiazole Schiff Bases
ASIAN JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY 13 : 12 Paper: e202400363 , 12 p. (2024)
DOI WoS
Közlemény:35978498 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35978498] [Egyeztetett]
11.
Mohamed, A.S. ; Salama, A.F. ; Sabaa, M.A. ; Toraih, E. ✉ ; Elshazli, R.M.
GEMIN4 Variants: Risk Profiling, Bioinformatics, and Dynamic Simulations Uncover Susceptibility to Bladder Carcinoma
ARCHIVES OF MEDICAL RESEARCH 55 : 3 Paper: 102970 (2024)
DOI WoS Scopus PubMed
Közlemény:34837339 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34837339] [Egyeztetett]
12.
Mulaudzi, Vhangani E. ; Adeosun, Idowu J. ; Adewumi, Adeniyi T. ; Soliman, Mahmoud E. S. ; Cosa, Sekelwa ✉
Helichrysum populifolium Compounds Inhibit MtrCDE Efflux Pump Transport Protein for the Potential Management of Gonorrhoea Infection
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 25 : 24 Paper: 13310 , 26 p. (2024)
DOI WoS
Közlemény:35978494 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35978494] [Egyeztetett]
13.
Rahmani, Ali ; Jafari, Rahim ✉ ; Nadri, Samad ✉
Molecular dynamics simulation in tissue engineering
BIOIMPACTS , 17 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35371751 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35371751] [Egyeztetett]
14.
Sadeghi, Alireza ; Mohammad Jasour, Amir ; Kowsari, Elaheh ; Gheibi, Mohammad ; Hadi Ghasemi, Mohammad ; Ramakrishna, Seeram
Comprehensive viewpoint on ionic liquids applications in sustainable pharmaceutical technology (experiments, simulations, and managerial insights)
JOURNAL OF MOLECULAR LIQUIDS 404 p. 124991 Paper: 124991 (2024)
DOI WoS Scopus Egyéb URL
Közlemény:34891045 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34891045] [Egyeztetett]
15.
Appadurai, R. ; Koneru, J.K. ; Bonomi, M. ; Robustelli, P. ✉ ; Srivastava, A. ✉
Clustering Heterogeneous Conformational Ensembles of Intrinsically Disordered Proteins with t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding
JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION (2023)
DOI WoS Scopus PubMed
Közlemény:34108187 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34108187] [Egyeztetett]
16.
Dunn, Timothy B. ; Lopez-Lopez, Edgar ; Kim, Taewon David ; Medina-Franco, Jose L. ✉ ; Miranda-Quintana, Ramon Alain ✉
Exploring activity landscapes with extended similarity: is Tanimoto enough?
MOLECULAR INFORMATICS 42 : 7 , 12 p. (2023)
DOI WoS Scopus
Közlemény:34349840 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34349840] [Egyeztetett]
17.
Kausar, Meena ; Pandey, Pallavi ; Bisht, Dheeraj ; Sengupta, Sounok ; Kumar, Deepak ✉ ; Arya, Kamal Kant
In-silico anti-vitiligo activity of glycyrrhizin as potential IL-17 inhibitor and in-vitro antioxidant potential of isolated glycyrrhizin from G. glabra
SOUTH AFRICAN JOURNAL OF BOTANY 162 pp. 381-390. , 10 p. (2023)
DOI WoS
Közlemény:34249866 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34249866] [Egyeztetett]
18.
Lopez-Perez, Kenneth ; Lopez-Lopez, Edgar ; Medina-Franco, Jose L. ✉ ; Miranda-Quintana, Ramon Alain ✉
Sampling and Mapping Chemical Space with Extended Similarity Indices
MOLECULES 28 : 17 Paper: 6333 , 15 p. (2023)
DOI WoS Scopus
Közlemény:34349841 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34349841] [Egyeztetett]
19.
Senol, Halil ✉ ; Ghaffari-Moghaddam, Mansour ✉ ; Bulut, Seyma ; Akbas, Fahri ; Kose, Aytekin ; Topcu, Gulacti
Synthesis and Anticancer Activity of Novel Derivatives of a,β-Unsaturated Ketones Based on Oleanolic Acid: in Vitro and in Silico Studies against Prostate Cancer Cells
CHEMISTRY & BIODIVERSITY 20 : 9 , 15 p. (2023)
DOI WoS Scopus
Közlemény:34366068 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34366068] [Egyeztetett]
2025-05-16 07:38