1.
Bae, H. ; Nguyen, C.M. ; Ruiz-Orera, J. ; Mills, N.L. ; Snyder, M.P. ; Jang, C. ; Shah, S.H. ; Hübner, N. ; Seldin, M.
Emerging Technologies and Future Directions in Interorgan Crosstalk Cardiometabolic Research
CIRCULATION RESEARCH 136 : 11 pp. 1494-1506. , 13 p. (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186429 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186429] [Nyilvános]
2.
Berg, M. ; Krabbendam, L. ; van, der Ploeg E.K. ; van, Nimwegen M. ; van, der Veer T. ; Banchero, M. ; Carpaij, O.A. ; Hoogenboezem, R. ; van, den Berge M. ; Bindels, E. et al.
Evidence for altered immune-structural cell crosstalk in cystic fibrosis revealed by single cell transcriptomics
JOURNAL OF CYSTIC FIBROSIS (2025)
DOI Scopus
Közlemény:35806740 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35806740] [Nyilvános]
3.
Biga, P.R. ; Duan, J.E. ; Young, T.E. ; Marks, J.R. ; Bronikowski, A. ; Decena, L.P. ; Randolph, E.C. ; Pavuluri, A.G. ; Li, G. ; Fang, Y. et al.
Hallmarks of aging: A user's guide for comparative biologists
AGEING RESEARCH REVIEWS 104 Paper: 102616 (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35684415 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35684415] [Egyeztetett]
4.
Camargo, S. ; Moskowitz, O. ; Giladi, A. ; Levinson, M. ; Balaban, R. ; Gola, S. ; Raizman, A. ; Lipczyc, K. ; Richter, A. ; Keren-Khadmy, N. et al.
Neutrophils physically interact with tumor cells to form a signaling niche promoting breast cancer aggressiveness
NATURE CANCER 6 : 3 pp. 540-558. Paper: 69 , 19 p. (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186435 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186435] [Nyilvános]
5.
Camargo, Sandra ; Moskowitz, Ori ; Giladi, Amir ; Levinson, Maiia ; Balaban, Roi ; Gola, Shani ; Raizman, Alice ; Lipczyc, Kelly ; Richter, Alon ; Keren-Khadmy, Noa et al.
Neutrophils physically interact with tumor cells to form a signaling niche promoting breast cancer aggressiveness
NATURE CANCER , 37 p. (2025)
DOI WoS
Közlemény:35977874 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35977874] [Egyeztetett]
6.
Chang, J. ; Lu, J. ; Liu, Q. ; Xiang, T. ; Zhang, S. ; Yi, Y. ; Li, D. ; Liu, T. ; Liu, Z. ; Chen, X. et al.
Single-cell multi-stage spatial evolutional map of esophageal carcinogenesis
CANCER CELL 43 : 3 pp. 380-397.e7. (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186431 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186431] [Nyilvános]
7.
Chen, M. ; Cheng, R. ; He, J. ; Chen, J. ; Zhang, J.
SMOPCA: spatially aware dimension reduction integrating multi-omics improves the efficiency of spatial domain detection
GENOME BIOLOGY 26 : 1 Paper: 135 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186436 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186436] [Nyilvános]
8.
Ding, L. ; Li, Q. ; Yang, W. ; Liu, T. ; Tian, T. ; Liu, Y. ; Zhang, C. ; Pan, B. ; Wang, B. ; Wu, F. et al.
Deciphering diverse cell-death patterns to predict the prognosis and potential therapy target of hepatocellular carcinoma patients
VIEW (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186405 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186405] [Nyilvános]
9.
Duan, L. ; Hashemi, M. ; Ngom, A. ; Rueda, L.
Ligand-receptor dynamics in heterophily-aware graph neural networks for enhanced cell type prediction from single-cell RNA-seq data
FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES 12 Paper: 1547231 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186410 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186410] [Nyilvános]
10.
Falvo, P. ✉ ; Gruener, S. ; Orecchioni, S. ; Pisati, F. ; Talarico, G. ; Mitola, G. ; Lombardi, D. ; Bravetti, G. ; Winkler, J. ; Barozzi, I. ✉ et al.
Age-dependent differences in breast tumor microenvironment: challenges and opportunities for efficacy studies in preclinical models
CELL DEATH AND DIFFERENTIATION Paper: 106 (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35806741 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35806741] [Nyilvános]
11.
Fang, S. ; Xu, M. ; Cao, L. ; Liu, X. ; Bezulj, M. ; Tan, L. ; Yuan, Z. ; Li, Y. ; Xia, T. ; Guo, L. et al.
Stereopy: modeling comparative and spatiotemporal cellular heterogeneity via multi-sample spatial transcriptomics
NATURE COMMUNICATIONS 16 : 1 Paper: 3741 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186421 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Sokszerzős vagy csoportos szerzőségű szakcikk ) Tudományos
Sokszerzős vagy csoportos szerzőségű szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186421] [Nyilvános]
12.
Feng, Bohai ✉ ; Zhao, Di ; Zhang, Zheng ; Jia, Ru ; Schuler, Patrick J. ; Hess, Jochen ✉
Ligand-receptor interactions combined with histopathology for improved prognostic modeling in HPV-negative head and neck squamous cell carcinoma
NPJ PRECISION ONCOLOGY 9 : 1 Paper: 57 , 17 p. (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35977879 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35977879] [Egyeztetett]
13.
Fischer, David S. ; Villanueva, Martin A. ; Winter, Peter S. ✉ ; Shalek, Alex K. ✉
Adapting systems biology to address the complexity of human disease in the single-cell era
NATURE REVIEWS GENETICS , 18 p. (2025)
DOI WoS Scopus PubMed
Közlemény:35968026 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35968026] [Egyeztetett]
14.
Gameiro, J.G. ; Hintschich, C.A. ; Dekeyser, A. ; Hox, V. ; Schwob, J.E. ; Holbrook, E.H. ; Fornazieri, M.A. ; Lin, B.
Quiescent horizontal basal stem cells act as a niche for olfactory neurogenesis in a mouse 3D organoid model
CELL REPORTS METHODS Paper: 101055 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186439 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186439] [Nyilvános]
15.
Ge, S. ; Sun, S. ; Xu, H. ; Cheng, Q. ; Ren, Z.
Deep learning in single-cell and spatial transcriptomics data analysis: advances and challenges from a data science perspective
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS 26 : 2 Paper: bbaf136 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186406 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186406] [Nyilvános]
16.
Held, M. ; Castillo-Madeen, H. ; Vigh-Conrad, K.A. ; Aston, K.I. ; Conrad, D.F.
Genetic and genomic insights into male reproductive tract development
FERTILITY AND STERILITY 123 : 6 pp. 970-979. , 10 p. (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186420 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186420] [Nyilvános]
17.
Iliakis, C.S. ; Crotta, S. ; Wack, A.
The Interplay Between Innate Immunity and Nonimmune Cells in Lung Damage, Inflammation, and Repair
ANNUAL REVIEW OF IMMUNOLOGY 43 : 1 pp. 395-422. , 28 p. (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186409 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186409] [Nyilvános]
18.
Ji, B. ; Wang, X. ; Wang, X. ; Xu, L. ✉ ; Peng, S. ✉
scDCA: deciphering the dominant cell communication assembly of downstream functional events from single-cell RNA-seq data
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS 26 : 1 Paper: 663 (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35806743 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35806743] [Egyeztetett]
19.
Kim, Kwansoo ; Han, Manyoung ; Lee, Doheon
InTiCAR: Network-based identification of significant inter-tissue communicators for autoimmune diseases
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL 27 pp. 333-345. , 13 p. (2025)
DOI WoS Scopus Egyéb URL
Közlemény:35680976 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35680976] [Nyilvános]
20.
Koelsch, N. ; Mirshahi, F. ; Aqbi, H.F. ; Seneshaw, M. ; Idowu, M.O. ; Olex, A.L. ; Sanyal, A.J. ; Manjili, M.H.
Anti-Tumour Immunity Relies on Targeting Tissue Homeostasis Through Monocyte-Driven Responses Rather Than Direct Tumour Cytotoxicity
LIVER INTERNATIONAL 45 : 5 Paper: 70110 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186437 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186437] [Nyilvános]
21.
Kooistra, S.M. ✉ ; Schirmer, L. ✉
Multiple Sclerosis: Glial Cell Diversity in Time and Space
GLIA 73 : 3 pp. 574-590. , 17 p. (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35806733 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35806733] [Egyeztetett]
22.
Korst, C.L.B.M. ; Tahri, S. ; Duetz, C. ; Bruins, W.S.C. ; de, Jonge A.V. ; de, Jong M.E. ; Fokkema, C. ; Smits, F. ; Groen, K. ; Verkleij, C.P.M. et al.
The bone marrow NK-cell profile predicts MRD negativity in patients with multiple myeloma treated with daratumumab-based therapy
BLOOD (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186430 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Sokszerzős vagy csoportos szerzőségű szakcikk ) Tudományos
Sokszerzős vagy csoportos szerzőségű szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186430] [Nyilvános]
23.
Kulasinghe, A. ; Berrell, N. ; Donovan, M.L. ; Nilges, B.S.
Spatial-Omics Methods and Applications
METHODS IN MOLECULAR BIOLOGY 2880 pp. 101-146. , 46 p. (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186443 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186443] [Nyilvános]
24.
Lee, Colin Y. C. ; Mccaffrey, James ; Mcgovern, Dominic ; Clatworthy, Menna R. ✉
Profiling immune cell tissue niches in the spatial-omics era
JOURNAL OF ALLERGY AND CLINICAL IMMUNOLOGY 155 : 3 pp. 663-677. , 15 p. (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35977876 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35977876] [Nyilvános]
25.
Licón-Muñoz, Y. ; Avalos, V. ; Subramanian, S. ; Granger, B. ; Martinez, F. ; García-Montaño, L.A. ; Varela, S. ; Moore, D. ; Perkins, E. ; Kogan, M. et al.
Single-nucleus and spatial landscape of the sub-ventricular zone in human glioblastoma
CELL REPORTS 44 : 1 Paper: 115149 (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35806736 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35806736] [Nyilvános]
26.
Li, H. ; Zhang, Z. ; Squires, M. ; Chen, X. ; Zhang, X.
scMultiSim: simulation of single-cell multi-omics and spatial data guided by gene regulatory networks and cell–cell interactions
NATURE METHODS 22 : 5 pp. 982-993. Paper: 4429 , 12 p. (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186434 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186434] [Nyilvános]
27.
Lin, Jing-Ping ✉ ; Brake, Alexis ; Donadieu, Maxime ; Lee, Amanda ; Smith, Ginger ; Hu, Kevin ; Nair, Govind ; Kawaguchi, Riki ; Sati, Pascal ; Geschwind, Daniel H. et al.
4D marmoset brain map reveals MRI and molecular signatures for onset of multiple sclerosis-like lesions
SCIENCE 387 : 6737 Paper: eadp6325 , 18 p. (2025)
DOI WoS
Közlemény:35977878 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35977878] [Egyeztetett]
28.
Liu, M. ; Zheng, S. ; Li, H. ; Budowle, B. ; Wang, L. ; Lou, Z. ; Ge, J.
High resolution tissue and cell type identification via single cell transcriptomic profiling
PLOS ONE 20 : 3 Paper: 0318151 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186432 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186432] [Nyilvános]
29.
Liu, Z. ; Yang, Y. ; Fang, H. ; Cen, B. ; Fan, Y. ; Li, J. ; Wang, L. ; He, S.
Single-cell and spatial analyses reveal the effect of VSIG4+S100A10+TAMs on the immunosuppression of glioblastoma and anti-PD-1 immunotherapy
INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES 308 Paper: 142415 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186417 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186417] [Nyilvános]
30.
Li, X. ; Pan, L. ; Li, W. ; Liu, B. ; Xiao, C. ; Chew, V. ; Zhang, X. ; Long, W. ; Ginhoux, F. ; Loscalzo, J. et al.
Deciphering immune predictors of immunotherapy response: A multiomics approach at the pan-cancer level
CELL REPORTS MEDICINE 6 : 4 Paper: 101992 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186411 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186411] [Nyilvános]
31.
Li, Y. ; Liu, X. ; Guo, L. ; Han, K. ; Fang, S. ; Wan, X. ; Wang, D. ; Xu, X. ; Jiang, L. ; Fan, G. et al.
SpaGRN: Investigating spatially informed regulatory paths for spatially resolved transcriptomics data
CELL SYSTEMS 16 : 4 Paper: 101243 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186413 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186413] [Nyilvános]
32.
Llera-Oyola, J. ; Pérez-Moraga, R. ; Parras, M. ; Rosón, B.
How to view the female reproductive tract through single-cell looking glasses
AMERICAN JOURNAL OF OBSTETRICS AND GYNECOLOGY 232 : 4 pp. S21-S43. (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186412 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186412] [Nyilvános]
33.
Luo, T. ; Liu, C. ; Cheng, T. ; Zhao, G.-Q. ; Huang, Y. ; Luan, J.-Y. ; Guo, J. ; Liu, X. ; Wang, Y.-F. ; Dong, Y. et al.
Establishing dorsal-ventral patterning in human neural tube organoids with synthetic organizers
CELL STEM CELL (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186419 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186419] [Nyilvános]
34.
Lusby, R. ; Demirdizen, E. ; Inayatullah, M. ; Kundu, P. ; Maiques, O. ; Zhang, Z. ; Terp, M.G. ; Sanz-Moreno, V. ; Tiwari, V.K. ✉
Pan-cancer drivers of metastasis
MOLECULAR CANCER 24 : 1 Paper: 2 (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35806730 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35806730] [Nyilvános]
35.
Lu, Yunfei ; Chen, Yang ; Wang, Zhenling ; Shen, Hengyang ; Xu, Lei ; Huang, Changzhi ; Tong, Ying ; Shao, Yu ; Zhang, Hongqiang ; Fu, Zan ✉
Single-cell and spatial transcriptome profiling reveal CTHRC1+fibroblasts promote EMT through WNT5A signaling in colorectal cancer
JOURNAL OF TRANSLATIONAL MEDICINE 23 : 1 Paper: 282 , 17 p. (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35977875 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35977875] [Egyeztetett]
36.
Lv, X. ; Liu, J. ; Ruan, J. ; Chen, P. ; He, C. ; Zhao, X. ; Huang, C. ; Chen, L. ; Wang, H. ; Hua, G. et al.
Targeting the disrupted Hippo signaling to prevent neoplastic renal epithelial cell immune evasion
NATURE COMMUNICATIONS 16 : 1 Paper: 2858 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186418 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186418] [Nyilvános]
37.
Marchand, V. ; Laplane, L. ; Valensi, L. ; Plo, I. ; Aglave, M. ; Silvin, A. ; Pasquier, F. ; Porteu, F. ; Vainchenker, W. ; Selimoglu-Buet, D. et al.
Monocytes generated by interleukin-6-treated human hematopoietic stem and progenitor cells secrete calprotectin that inhibits erythropoiesis
ISCIENCE 28 : 1 Paper: 111522 (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35806737 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35806737] [Egyeztetett]
38.
Mavuluri, J. ; Dhungana, Y. ; Jones, L.L. ; Bhatara, S. ; Shi, H. ; Yang, X. ; Lim, S.-E. ; Reyes, N. ; Chi, H. ; Yu, J. et al.
GPR65 Inactivation in Tumor Cells Drives Antigen-Independent CAR T-cell Resistance via Macrophage Remodeling
CANCER DISCOVERY 15 : 5 pp. 1018-1036. , 19 p. (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186414 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186414] [Nyilvános]
39.
Mimpen, J.Y. ; Baldwin, M.J. ; Paul, C. ; Ramos-Mucci, L. ; Kurjan, A. ; Cohen, C.J. ; Sharma, S. ; Chevalier, Florquin M.S.N. ; Hulley, P.A. ; McMaster, J. et al.
Exploring cellular changes in ruptured human quadriceps tendons at single-cell resolution
JOURNAL OF PHYSIOLOGY-LONDON (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186428 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186428] [Nyilvános]
40.
Mori-Ichioka, A. ; Shigeta, H. ; Seno, S. ; Matsuda, H.
Communication Analysis between Human Hair-Follicles and Immune Cells with Single-cell RNA-seq
In: ICBBE 2024 - Proceedings of 2024 11th International Conference on Biomedical and Bioinformatics Engineering
Association for Computing Machinery, Inc (2025) pp. 248-252. , 5 p.
DOI Scopus
Közlemény:36186438 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Konferenciaközlemény ) Tudományos
Konferenciaközlemény (Könyvrészlet) | Tudományos[36186438] [Nyilvános]
41.
Morival, J. ; Hazelwood, A. ; Lammerding, J.
Feeling the force from within – new tools and insights into nuclear mechanotransduction
JOURNAL OF CELL SCIENCE 138 : 5 Paper: jcs263615 (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:36080395 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36080395] [Nyilvános]
42.
Nagai, J.S. ; Maie, T. ; Schaub, M.T. ; Costa, I.G.
scACCorDiON: a clustering approach for explainable patient level cell–cell communication graph analysis
BIOINFORMATICS 41 : 5 Paper: btaf288 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186424 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186424] [Nyilvános]
43.
Nonn, O. ; Debnath, O. ; Valdes, D.S. ; Sallinger, K. ; Secener, A.K. ; Fischer, C. ; Tiesmeyer, S. ; Nimo, J. ; Kuenzer, T. ; Ulrich, J. et al.
Senescent Syncytiotrophoblast Secretion During Early Onset Preeclampsia
HYPERTENSION 82 : 5 pp. 787-799. , 13 p. (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35618985 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Sokszerzős vagy csoportos szerzőségű szakcikk ) Tudományos
Sokszerzős vagy csoportos szerzőségű szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35618985] [Nyilvános]
44.
Potts, C. ; Yang, C. ; Liaw, L.
NOTCH Signaling Networks in Perivascular Adipose Tissue
ARTERIOSCLEROSIS THROMBOSIS AND VASCULAR BIOLOGY 45 : 6 pp. 845-856. , 12 p. (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186399 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186399] [Nyilvános]
45.
Puniya, B.L.
Artificial-intelligence-driven Innovations in Mechanistic Computational Modeling and Digital Twins for Biomedical Applications
JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY Paper: 169181 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186416 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186416] [Nyilvános]
46.
Rafi, F.R. ; Heya, N.R. ; Hafiz, M.S. ; Jim, J.R. ; Kabir, M.M. ; Mridha, M.F. ✉
A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and innovations
COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY 115 Paper: 108362 (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35806731 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35806731] [Nyilvános]
47.
Ridano, M.E. ; Hanke-Gogokhia, C. ; Lehmann, G.L. ; Caceres, P.S. ; Vaglienti, M.V. ; Ceschin, D. ; Schreiner, R. ; Croci, D.O. ; Torroja-Fungairiño, C. ; Rodriguez-Boulan, E. et al.
Stromal-Like Cells and Retinal Pigment Epithelium Modulate Choroidal Sprouting Through Galectin-1-Dependent and Independent Pathways
FASEB JOURNAL 39 : 10 Paper: 70671 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186425 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186425] [Nyilvános]
48.
Rodov, A. ; Baniadam, H. ; Zeiser, R. ; Amit, I. ; Yosef, N. ; Wertheimer, T. ✉ ; Ingelfinger, F. ✉
Towards the Next Generation of Data-Driven Therapeutics Using Spatially Resolved Single-Cell Technologies and Generative AI
EUROPEAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY 55 : 2 Paper: 202451234 (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35806735 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35806735] [Egyeztetett]
49.
Sang-aram, Chananchida ; Browaeys, Robin ; Seurinck, Ruth ; Saeys, Yvan ✉
Unraveling cell-cell communication with NicheNet by inferring active ligands from transcriptomics data
NATURE PROTOCOLS , 29 p. (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35977877 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35977877] [Egyeztetett]
50.
Sarkar, H. ; Lee, E. ; Lopez-Darwin, S.L. ; Kang, Y. ✉
Deciphering normal and cancer stem cell niches by spatial transcriptomics: opportunities and challenges
GENES & DEVELOPMENT 39 : 1-2 pp. 64-85. , 22 p. (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35775703 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35775703] [Egyeztetett]
51.
Schott, M. ; León-Periñán, D. ; Splendiani, E. ; Ferretti, E. ; Macino, G. ✉ ; Karaiskos, N. ✉ ; Rajewsky, N. ✉
Protocol for high-resolution 3D spatial transcriptomics using Open-ST
STAR PROTOCOLS 6 : 1 Paper: 103521 (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35806732 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35806732] [Nyilvános]
52.
Sun, Fengying ; Li, Haoyan ; Sun, Dongqing ; Fu, Shaliu ; Gu, Lei ; Shao, Xin ; Wang, Qinqin ; Dong, Xin ; Duan, Bin ; Xing, Feiyang et al.
Single-cell omics: experimental workflow, data analyses and applications
SCIENCE CHINA LIFE SCIENCES 68 : 1 pp. 5-102. , 98 p. (2025)
DOI WoS Scopus PubMed
Közlemény:35313914 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35313914] [Nyilvános]
53.
Troulé, K. ; Petryszak, R. ; Cakir, B. ; Cranley, J. ; Harasty, A. ; Prete, M. ; Tuong, Z.K. ; Teichmann, S.A. ; Garcia-Alonso, L. ; Vento-Tormo, R.
CellPhoneDB v5: inferring cell–cell communication from single-cell multiomics data
NATURE PROTOCOLS Paper: 6619 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186403 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186403] [Nyilvános]
54.
van, Santvoort M. ; Lapuente-Santana, Ó. ; Zopoglou, M. ; Zackl, C. ; Finotello, F. ; van, der Hoorn P. ; Eduati, F. ✉
Mathematically mapping the network of cells in the tumor microenvironment
CELL REPORTS METHODS 5 : 2 Paper: 100985 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:35806734 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35806734] [Nyilvános]
55.
Wu, B. ; Constanty, F. ; Beisaw, A.
Cardiac regeneration: Unraveling the complex network of intercellular crosstalk
SEMINARS IN CELL & DEVELOPMENTAL BIOLOGY 171 Paper: 103619 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186422 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186422] [Nyilvános]
56.
Wu, G. ; Liang, Y. ; Xi, Q. ; Zuo, Y.
New Insights and Implications of Cell–Cell Interactions in Developmental Biology
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 26 : 9 Paper: 3997 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186433 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186433] [Nyilvános]
57.
Wu, J. ; Liu, X. ; Huang, S. ; Liu, W.
Identification of a Cancer Stem Cell-Related Gene Signature in Hepatocellular Carcinoma Based on Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Analysis
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 26 : 7 Paper: 2933 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186400 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186400] [Nyilvános]
58.
Wu, W. ; Wang, Z. ; Liu, L. ; Huang, J. ; Qiu, H. ; Peng, L. ; Nie, L.
Prediction of Ligand-Receptor Interactions Based on CatBoost and Deep Forest and Their Application in Cell-Cell Communication Analysis
JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186404 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186404] [Nyilvános]
59.
Xia, H. ; Ji, B. ✉ ; Qiao, D. ; Peng, S. ✉
CellMsg: graph convolutional networks for ligand–receptor-mediated cell-cell communication analysis
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS 26 : 1 Paper: 716 (2025)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35806742 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35806742] [Nyilvános]
60.
Xue, Z. ; Xuan, H. ; Lau, K. ; Su, Y. ; Wegener, M. ; Li, K. ; Turner, L. ; Adams, M. ; Shi, X. ; Wen, H.
Expression of ENL YEATS domain tumor mutations in nephrogenic or stromal lineage impairs kidney development
NATURE COMMUNICATIONS 16 : 1 Paper: 2531 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186402 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186402] [Nyilvános]
61.
Yan, L. ; Cheng, J. ; Nie, Q. ; Sun, X.
Dissecting multilayer cell–cell communications with signaling feedback loops from spatial transcriptomics data
GENOME RESEARCH 35 : 6 pp. 1400-1414. , 15 p. (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186423 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186423] [Nyilvános]
62.
Yu, W. ; Biyik-Sit, R. ; Uzun, Y. ; Chen, C.-H. ; Thadi, A. ; Sussman, J.H. ; Pang, M. ; Wu, C.-Y. ; Grossmann, L.D. ; Gao, P. et al.
Longitudinal single-cell multiomic atlas of high-risk neuroblastoma reveals chemotherapy-induced tumor microenvironment rewiring
NATURE GENETICS 57 : 5 pp. 1142-1154. Paper: 3620 , 13 p. (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186408 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186408] [Nyilvános]
63.
Zeng, P.Y.F. ; Lin, R.J. ; Fung, K. ; Khan, H. ; Cecchini, M.J. ; Woo, E. ; Hu, A. ; Anderson, J. ; MacInnis, P. ; Jarycki, L. et al.
Cellular blueprint of healthy and diseased human epiglottis and subglottis—a study of the Canadian Airways Research (CARE) group
EBIOMEDICINE 114 Paper: 105631 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186401 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186401] [Nyilvános]
64.
Zhang, T. ; Wu, Z. ; Li, L. ; Ren, J. ; Zhang, Z. ; Zhang, J. ; Wang, G.
CellGAT: A GAT-Based Method for Constructing a Cell Communication Network Integrating Multiomics Information
BIOMOLECULES 15 : 3 Paper: 342 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186426 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186426] [Nyilvános]
65.
Zhang, Y. ; Zhu, J. ; Hu, K. ; Qiu, J. ; Zhang, F.
Multi-omics analyses construct an inflammatory response based prognostic gene signature for cervical cancer and suggest tumor infiltrating monocytes subgroups as key players
FRONTIERS IN IMMUNOLOGY 16 Paper: 1563593 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186415 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186415] [Nyilvános]
66.
Zhu, S. ; Jaworski, A. ; Meijers, R.
Expanding ligand-receptor interaction networks for axon guidance: Structural insights into signal crosstalk and specificity
CURRENT OPINION IN NEUROBIOLOGY 92 Paper: 102999 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186427 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186427] [Nyilvános]
67.
Zhu, X. ; Zhang, Y. ; Liao, H. ; Hu, J. ; Xiao, X.
Crosstalk Between Gastric Cancer and Adjacent Mucosa Reveals EDN1-EDNRA-Mediated Regulation of Cancer Stemness and Immunomodulation Networks
JOURNAL OF CELLULAR AND MOLECULAR MEDICINE 29 : 8 Paper: 70547 (2025)
DOI Scopus
Közlemény:36186407 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36186407] [Nyilvános]
68.
Almet, Axel A. ; Tsai, Yuan-Chen ; Watanabe, Momoko ; Nie, Qing ✉
Inferring pattern-driving intercellular flows from single-cell and spatial transcriptomics
NATURE METHODS , 19 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35371450 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35371450] [Egyeztetett]
69.
Appios, Anna ; Davies, James ; Sirvent, Sofia ; Henderson, Stephen ; Trzebanski, Sebastien ; Schroth, Johannes ; Law, Morven L. ; Carvalho, Ines Boal ; Pinto, Marlene Magalhaes ; Carvalho, Cyril et al.
Convergent evolution of monocyte differentiation in adult skin instructs Langerhans cell identity
SCIENCE IMMUNOLOGY 9 : 99 Paper: eadp0344 , 18 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35371448 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35371448] [Egyeztetett]
70.
Armingol, E. ✉ ; Baghdassarian, H.M. ; Lewis, N.E. ✉
The diversification of methods for studying cell–cell interactions and communication
NATURE REVIEWS GENETICS 25 : 6 pp. 381-400. , 20 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:34632225 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34632225] [Nyilvános]
71.
Arora, C. ; Matic, M. ; Bisceglia, L. ; Di, Chiaro P. ; De, Oliveira Rosa N. ; Carli, F. ; Clubb, L. ; Nemati, Fard L.A. ; Kargas, G. ; Diaferia, G.R. et al.
The landscape of cancer-rewired GPCR signaling axes
CELL GENOMICS 4 : 5 Paper: 100557 (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:34847209 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34847209] [Egyeztetett]
72.
Baghdassarian, H.M. ; Dimitrov, D. ; Armingol, E. ; Saez-Rodriguez, J. ✉ ; Lewis, N.E. ✉
Combining LIANA and Tensor-cell2cell to decipher cell-cell communication across multiple samples
CELL REPORTS METHODS 4 : 4 Paper: 100758 (2024)
DOI WoS Scopus PubMed
Közlemény:34823395 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34823395] [Egyeztetett]
73.
Bartels, T. ; Rowitch, D.H. ✉ ; Bayraktar, O.A. ✉
Generation of Mammalian Astrocyte Functional Heterogeneity
COLD SPRING HARBOR PERSPECTIVES IN BIOLOGY 16 : 11 Paper: a041351 (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35618964 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35618964] [Nyilvános]
74.
Bhuiyan, Shamsuddin A. ; Xu, Mengyi ; Yang, Lite ; Semizoglou, Evangelia ; Bhatia, Parth ; Pantaleo, Katerina I. ; Tochitsky, Ivan ; Jain, Aakanksha ; Erdogan, Burcu ; Blair, Steven et al.
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
SCIENCE ADVANCES 10 : 25 Paper: eadj9173 , 21 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35371453 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35371453] [Egyeztetett]
75.
Bleckwehl, Tore ; Babler, Anne ; Tebens, Merel ; Maryam, Sidrah ; Nyberg, Michael ; Bosteen, Markus ; Halder, Maurice ; Shaw, Isaac ; Fleig, Susanne ; Pyke, Charles et al.
Encompassing view of spatial and single-cell RNA sequencing renews the role of the microvasculature in human atherosclerosis
NATURE CARDIOVASCULAR RESEARCH 4 : 1 pp. 26-44. , 37 p. (2024)
DOI WoS Scopus PubMed
Közlemény:36148502 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[36148502] [Nyilvános]
76.
Bormann, Daniel ; Knoflach, Michael ; Poreba, Emilia ; Riedl, Christian J. ; Testa, Giulia ; Orset, Cyrille ; Levilly, Anthony ; Cottereau, Andrea ; Jauk, Philipp ; Hametner, Simon et al.
Single-nucleus RNA sequencing reveals glial cell type-specific responses to ischemic stroke in male rodents
NATURE COMMUNICATIONS 15 : 1 Paper: 6232 , 23 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35371460 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35371460] [Egyeztetett]
77.
Bromley, J.D. ; Ganchua, S.K.C. ; Nyquist, S.K. ; Maiello, P. ; Chao, M. ; Borish, H.J. ; Rodgers, M. ; Tomko, J. ; Kracinovsky, K. ; Mugahid, D. et al.
CD4+ T cells re-wire granuloma cellularity and regulatory networks to promote immunomodulation following Mtb reinfection
IMMUNITY 57 : 10 pp. 2380-2398.e6. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35618968 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35618968] [Egyeztetett]
78.
Cerapio, Juan Pablo ; Gravelle, Pauline ; Quillet-Mary, Anne ; Valle, Carine ; Martins, Frederic ; Franchini, Don-Marc ; Syrykh, Charlotte ; Brousset, Pierre ; Traverse-Glehen, Alexandra ; Ysebaert, Loic et al.
Integrated spatial and multimodal single-cell transcriptomics reveal patient-dependent cell heterogeneity in splenic marginal zone lymphoma
JOURNAL OF PATHOLOGY , 12 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35008741 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35008741] [Egyeztetett]
79.
Chap, B.S. ; Rayroux, N. ; Grimm, A.J. ; Ghisoni, E. ; Dangaj, Laniti D.
Crosstalk of T cells within the ovarian cancer microenvironment
TRENDS IN CANCER 10 : 12 pp. 1116-1130. , 15 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35618959 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35618959] [Nyilvános]
80.
Chávez, M.N. ✉ ; Arora, P. ; Meer, M. ; Marques, I.J. ; Ernst, A. ; Morales, Castro R.A. ; Mercader, N. ✉
Spns1-dependent endocardial lysosomal function drives valve morphogenesis through Notch1-signaling
ISCIENCE 27 : 12 Paper: 111406 (2024)
DOI WoS Scopus PubMed
Közlemény:35641834 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35641834] [Nyilvános]
81.
Chen, Wenyu ; Miao, Chen ; Zhang, Zhenghao ; Fung, Cathy Sin-Hang ; Wang, Ran ; Chen, Yizhen ; Qian, Yan ; Cheng, Lixin ; Yip, Kevin Y. ✉ ; Tsui, Stephen Kwok-Wing ✉ et al.
Commonly used software tools produce conflicting and overly-optimistic AUPRC values
GENOME BIOLOGY 25 : 1 Paper: 118 , 12 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:34996753 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34996753] [Egyeztetett]
82.
Cho, Juok ; Baik, Bukyung ; Nguyen, Hai C. T. ; Park, Daeui ; Nam, Dougu ✉
Characterizing efficient feature selection for single-cell expression analysis
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS 25 : 4 Paper: bbae317 , 12 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35371455 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35371455] [Egyeztetett]
83.
Coffey, D.G. ✉ ; Ataca, Atilla P. ; Atilla, E. ; Landgren, O. ; Cowan, A.J. ; Simon, S. ; Pont, M.J. ; Comstock, M.L. ; Hill, G.R. ; Riddell, S.R. et al.
Single-cell analysis of the multiple myeloma microenvironment after γ-secretase inhibition and CAR T-cell therapy
BLOOD (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35618987 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35618987] [Nyilvános]
84.
Colonna, M. ✉ ; Konopka, G. ✉ ; Liddelow, S.A. ✉ ; Nowakowski, T. ✉ ; Awatramani, R. ; Bateup, H.S. ; Cadwell, C.R. ; Caglayan, E. ; Chen, J.L. ; Gillis, J. et al.
Implementation and validation of single-cell genomics experiments in neuroscience
NATURE NEUROSCIENCE 27 : 12 pp. 2310-2325. Paper: 8746 , 16 p. (2024)
DOI WoS Scopus PubMed
Közlemény:35706278 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35706278] [Egyeztetett]
85.
Corvino, D. ✉ ; Batstone, M. ; Hughes, B.G.M. ; Kempchen, T. ; Ng, S.S. ; Salim, N. ; Schneppenheim, F. ; Rommel, D. ; Kumar, A. ; Pearson, S. et al.
Type I Interferon Drives a Cellular State Inert to TCR-Stimulation and Could Impede Effective T-Cell Differentiation in Cancer
EUROPEAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35618984 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35618984] [Nyilvános]
86.
Curto, Y. ; Carceller, H. ; Klimczak, P. ; Perez-Rando, M. ; Wang, Q. ; Grewe, K. ; Kawaguchi, R. ; Rizzoli, S. ; Geschwind, D. ; Nave, K.-A. et al.
Erythropoietin restrains the inhibitory potential of interneurons in the mouse hippocampus
MOLECULAR PSYCHIATRY 29 : 10 pp. 2979-2996. , 18 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:34847218 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34847218] [Nyilvános]
87.
Dardano, M. ✉ ; Kleemiß, F. ; Kosanke, M. ; Lang, D. ; Wilson, L. ; Franke, A. ; Teske, J. ; Shivaraj, A. ; de, la Roche J. ; Fischer, M. et al.
Blood-generating heart-forming organoids recapitulate co-development of the human haematopoietic system and the embryonic heart
NATURE CELL BIOLOGY 26 : 11 pp. 1984-1996. , 13 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35618963 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35618963] [Egyeztetett]
88.
de, Jong M.M.E. ; Fokkema, C. ; Papazian, N. ; Czeti, Á. ; Appelman, M.K. ; Vermeulen, M. ; van, Heusden T. ; Hoogenboezem, R.M. ; van, Beek G. ; Tahri, S. et al.
An IL-1β-driven neutrophil–stromal cell axis fosters a BAFF-rich protumor microenvironment in individuals with multiple myeloma
NATURE IMMUNOLOGY 25 pp. 820-833. , 14 p. (2024)
DOI WoS Scopus PubMed
Közlemény:34795370 Egyeztetett Forrás Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Nyilvános idéző összesen: 14 | Független: 13 | Függő: 1 | Nem jelölt: 0 | WoS jelölt: 14 | Scopus jelölt: 13 | WoS/Scopus jelölt: 14 | DOI jelölt: 14
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34795370] [Egyeztetett]
Nyilvános idéző összesen: 14, Független: 13, Függő: 1, Nem jelölt: 0
89.
Dimitrov, Daniel ; Schaefer, Philipp Sven Lars ; Farr, Elias ; Rodriguez-Mier, Pablo ; Lobentanzer, Sebastian ; Badia-i-Mompel, Pau ; Dugourd, Aurelien ; Tanevski, Jovan ; Flores, Ricardo Omar Ramirez ; Saez-Rodriguez, Julio ✉
LIANA plus provides an all-in-one framework for cell-cell communication inference
NATURE CELL BIOLOGY , 30 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35371451 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35371451] [Egyeztetett]
90.
Elkjaer, Maria L. ; Hartebrodt, Anne ; Oubounyt, Mhaned ; Weber, Anna ; Vitved, Lars ; Reynolds, Richard ; Thomassen, Mads ; Rottger, Richard ; Baumbach, Jan ; Illes, Zsolt
Single-Cell Multi-Omics Map of Cell Type–Specific Mechanistic Drivers of Multiple Sclerosis Lesions
NEUROLOGY-NEUROIMMUNOLOGY & NEUROINFLAMMATION 11 : 3 Paper: e200213 (2024)
DOI WoS Scopus PubMed Egyéb URL
Közlemény:34831850 Egyeztetett Forrás Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Nyilvános idéző összesen: 5 | Független: 4 | Függő: 1 | Nem jelölt: 0 | WoS jelölt: 5 | Scopus jelölt: 2 | WoS/Scopus jelölt: 5 | DOI jelölt: 4
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34831850] [Egyeztetett]
Nyilvános idéző összesen: 5, Független: 4, Függő: 1, Nem jelölt: 0
91.
Ewoldt, J.K. ; Wang, M.C. ; McLellan, M.A. ; Cloonan, P.E. ; Chopra, A. ; Gorham, J. ; Li, L. ; DeLaughter, D.M. ; Gao, X. ; Lee, J.H. et al.
Hypertrophic cardiomyopathy-associated mutations drive stromal activation via EGFR-mediated paracrine signaling
SCIENCE ADVANCES 10 : 42 Paper: adi6927 (2024)
DOI WoS Scopus PubMed
Közlemény:35618965 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35618965] [Nyilvános]
92.
Farr, Elias ; Dimitrov, Daniel ; Schmidt, Christina ; Turei, Denes ; Lobentanzer, Sebastian ; Dugourd, Aurelien ; Saez-Rodriguez, Julio ✉
MetalinksDB: a flexible and contextualizable resource of metabolite-protein interactions
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS 25 : 4 Paper: bbae347 , 12 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35371454 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35371454] [Egyeztetett]
93.
Feng, Sifan ; Wang, Zhenyou ; Jin, Yinghua ✉ ; Xu, Shengbin
TabDEG: Classifying differentially expressed genes from RNA-seq data based on feature extraction and deep learning framework
PLOS ONE 19 : 7 Paper: e0305857 , 22 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35371458 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35371458] [Egyeztetett]
94.
Fitzsimons, E. ; Qian, D. ✉ ; Enica, A. ; Thakkar, K. ; Augustine, M. ; Gamble, S. ; Reading, J.L. ; Litchfield, K. ✉
A pan-cancer single-cell RNA-seq atlas of intratumoral B cells
CANCER CELL 42 : 10 pp. 1784-1797.e4. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35618967 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35618967] [Egyeztetett]
95.
Flores, R.O.R. ; Schafer, P.S.L. ; Kuchenhoff, L. ; Saez-Rodriguez, J.
Complementing Cell Taxonomies with a Multicellular Analysis of Tissues
PHYSIOLOGY 39 : 3 pp. 129-141. , 13 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:34798180 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos
Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34798180] [Nyilvános]
96.
Friedrich, V.D. ; Pennitz, P. ; Wyler, E. ; Adler, J.M. ; Postmus, D. ; Müller, K. ; Teixeira, Alves L.G. ; Prigann, J. ; Pott, F. ; Vladimirova, D. et al.
Neural network-assisted humanisation of COVID-19 hamster transcriptomic data reveals matching severity states in human disease
EBIOMEDICINE 108 Paper: 105312 (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35470011 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35470011] [Nyilvános]
97.
Gao, Y. ; Li, J. ; Cheng, W. ; Diao, T. ; Liu, H. ; Bo, Y. ; Liu, C. ; Zhou, W. ; Chen, M. ; Zhang, Y. et al.
Cross-tissue human fibroblast atlas reveals myofibroblast subtypes with distinct roles in immune modulation
CANCER CELL 42 : 10 pp. 1764-1783.e10. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35618966 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35618966] [Nyilvános]
98.
Geng, H. ; Huang, C. ; Xu, L. ; Zhou, Y. ; Dong, Z. ; Zhong, Y. ; Li, Q. ; Yang, C. ; Huang, S. ; Liao, W. et al.
Targeting cellular senescence as a therapeutic vulnerability in gastric cancer
LIFE SCIENCES 346 Paper: 122631 (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:34847207 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34847207] [Egyeztetett]
99.
Ghasemi, David R. ; Okonechnikov, Konstantin ; Rademacher, Anne ; Tirier, Stephan ; Maass, Kendra K. ; Schumacher, Hanna ; Joshi, Piyush ; Gold, Maxwell P. ; Sundheimer, Julia ; Statz, Britta et al.
Compartments in medulloblastoma with extensive nodularity are connected through differentiation along the granular precursor lineage
NATURE COMMUNICATIONS 15 : 1 Paper: 269 , 20 p. (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:34600569 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34600569] [Egyeztetett]
100.
Gibson, A. ; Ram, R. ; Gangula, R. ; Li, Y. ; Mukherjee, E. ; Palubinsky, A.M. ; Campbell, C.N. ; Thorne, M. ; Konvinse, K.C. ; Choshi, P. et al.
Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis
NATURE COMMUNICATIONS 15 : 1 Paper: 8722 (2024)
DOI WoS Scopus
Közlemény:35618958 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos
Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35618958] [Nyilvános]
2025-07-14 11:54