MTMT2: publication list

Chakkittukandiyil, A. ; Chakraborty, S. ; Kothandan, R. ; Rymbai, E. ; Muthu, S.K. ; Vasu, S. ; Sajini, D.V. ; Sugumar, D. ; Mohammad, Z.B. ; Jayaram, S. et al.

Side effects based network construction and drug repositioning of ropinirole as a potential molecule for Alzheimer’s disease: an in-silico, in-vitro, and in-vivo study

JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS 42 : 20 pp. 10785-10799. , 15 p. (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34172239 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34172239] [Egyeztetett]

12.

Chandra, A. ; Goyal, N. ; Behera, A. ; Samanta, J. ; Sharma, T.

Artificial intelligence-based protein structure prediction and systems biology-guided smart drug screening

In: Mithun, Rudrapal; Chukwuebuka, Egbuna; William, C. Cho (szerk.) Biochemical and Molecular Pharmacology in Drug Discovery

Amsterdam, Hollandia : Elsevier (2024) pp. 323-352. , 30 p.

DOI Scopus

Közlemény:35259096 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Könyvfejezet ) Tudományos

Könyvfejezet (Könyvrészlet) | Tudományos[35259096] [Nyilvános]

13.

Chen, Hongyu ; Lu, Dong ; Xiao, Ziyi ; Li, Shensuo ; Zhang, Wen ; Luan, Xin ✉ ; Zhang, Weidong ✉ ; Zheng, Guangyong ✉

Comprehensive applications of the artificial intelligence technology in new drug research and development

HEALTH INFORMATION SCIENCE AND SYSTEMS 12 : 1 Paper: 41 , 17 p. (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:35269894 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos

Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35269894] [Egyeztetett]

14.

Chen, Zehui ; Li, Zimeng ; Shen, Xiangzhen ; Liu, Yuansheng ✉ ; Lin, Xuan ; Zeng, Daojian ; Zeng, Xiangxiang

DualSyn: A dual-level feature interaction method to predict synergistic drug combinations

EXPERT SYSTEMS WITH APPLICATIONS 257 Paper: 125065 , 13 p. (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:35295380 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35295380] [Egyeztetett]

15.

Chernogubova, E.A. ; Avetyan, A.V. ; Chibichyan, M.B. ✉ ; Kogan, M.I.

Expression of angiotensin II type 2 receptors and syndecan-1 in prostate cancer

VESTNIK UROLOGII / UROLOGY HERALD 12 : 5 pp. 45-54. , 10 p. (2024)

DOI Scopus

Közlemény:35692854 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35692854] [Nyilvános]

16.

Dong, Y. ✉ ; Bai, Y. ; Liu, H. ; Yang, Z. ; Chang, Y. ; Li, J. ; Han, Q. ; Feng, X. ; Fan, X. ; Ren, X.

DKPE-GraphSYN: a drug synergy prediction model based on joint dual kernel density estimation and positional encoding for graph representation

FRONTIERS IN GENETICS 15 Paper: 1401544 (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:35118486 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35118486] [Egyeztetett]

17.

Du, R. ; Zhang, N. ; Zhang, M. ; Kong, Z. ; Jia, Q. ; Dong, G. ✉ ; Tian, L. ; Ahsan, M.

Identifying the optimal node group of carbon emission efficiency correlation network in China based on pinning control theory

APPLIED ENERGY 368 Paper: 123353 (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:35118472 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35118472] [Nyilvános]

18.

Giuliani, A. ✉

The Search for System’s Parameters: Statistical and Dynamical Description from Complex Network Analysis

METHODS IN MOLECULAR BIOLOGY 2745 pp. 21-30. , 10 p. (2024)

DOI Scopus

Közlemény:34823402 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34823402] [Nyilvános]

19.

Giuliani, A. ✉

The Search for System’s Parameters: Statistical and Dynamical Description from Complex Network Analysis

In: Mohini, Gore; Umesh, B. Jagtap (szerk.) Computational Drug Discovery and Design

New York, Amerikai Egyesült Államok : Humana Press (2024) pp. 21-30. , 10 p.

DOI Scopus

Közlemény:35692857 Nyilvános Idéző Duplum Könyvrészlet (Könyvfejezet ) Tudományos

Könyvfejezet (Könyvrészlet) | Tudományos[35692857] [Nyilvános]

20.

Govind, N. ✉ ; Lal, R.P.

Selecting Influential Nodes in Social Networks Using Neighborhood Coreness

SN COMPUTER SCIENCE 5 : 1 Paper: 100 (2024)

DOI Scopus

Közlemény:34740527 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34740527] [Nyilvános]

21.

Kosuru, R.Y. ; Srinivasan, V. ✉ ; Jhonsi, M.A.

Biomass-derived potential nano-biomaterials: Protein binding, anti-biofilm activity and bio-imaging

JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE 1300 Paper: 137155 (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34504136 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34504136] [Nyilvános]

22.

Kuru, H.I. ; Cicek, A.E. ✉ ; Tastan, O. ✉

From cell lines to cancer patients: personalized drug synergy prediction

BIOINFORMATICS 40 : 5 Paper: 134 (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:35444949 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35444949] [Nyilvános]

23.

Li, H. ; Li, M. ; Zhang, F. ✉

Prediction of synergistic effects of drug combinations for cancer treatment based on multi-level information fusion

In: Piccaluga, P.P.; El-Hashash, A.; Guo, X. (szerk.) 4th International Conference on Biomedicine and Bioinformatics Engineering, ICBBE 2024

SPIE (2024) Paper: 1325223

DOI Scopus

Közlemény:35462335 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Konferenciaközlemény ) Tudományos

Konferenciaközlemény (Könyvrészlet) | Tudományos[35462335] [Nyilvános]

24.

Li, Lei ; Lu, Guodong ; Zheng, Chunhou ✉ ; Lin, Renyong ✉ ; Su, Yansen ✉

MHCLSyn: Multi-View Hypergraph Contrastive Learning for Synergistic Drug Combination Prediction

Big Data Mining and Analytics 7 : 4 pp. 1273-1286. , 14 p. (2024)

DOI WoS

Közlemény:35851388 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35851388] [Egyeztetett]

25.

Liu, J. ; Guan, S. ; Wang, Z. ; Wang, Y. ✉

Deconstructing the relationship between prescriptions and patterns under network image-number thinking: reflection on technological innovation from Chinese original thinking∗

BEIJING ZHONGYIYAO DAXUE XUEBAO / JOURNAL OF BEIJING UNIVERSITY OF TRADITIONAL CHINESE MEDICINE 47 : 10 pp. 1367-1375. , 9 p. (2024)

DOI Scopus

Közlemény:35692851 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35692851] [Nyilvános]

26.

Mehmood, Aamir ; Kaushik, Aman Chandra ; Wei, Dong-Qing ✉

DDSBC: A Stacking Ensemble Classifier-Based Approach for Breast Cancer Drug-Pair Cell Synergy Prediction

JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING 64 : 16 pp. 6421-6431. , 11 p. (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:35295381 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35295381] [Egyeztetett]

27.

Mohammad, B.B. ; Dhuli, S. ; Enduri, M.K. ; Cenkeramaddi, L.R. ✉

Convex Isolating Clustering Centrality to Discover the Influential Nodes in Large Scale Networks

IEEE ACCESS 12 pp. 48404-48419. Paper: 10488414 , 16 p. (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34823401 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34823401] [Egyeztetett]

28.

Mohammad, B.B. ; Dhuli, S. ; Enduri, M.K. ✉

Isolating Centrality-Based Generalization of Traditional Centralities to Discover Vital Nodes in Complex Networks

ARABIAN JOURNAL FOR SCIENCE AND ENGINEERING (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:35692856 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35692856] [Egyeztetett]

29.

Pang, Yu ; Chen, Yihao ; Lin, Mujie ; Zhang, Yanhong ; Zhang, Jiquan ; Wang, Ling

MMSyn: A New Multimodal Deep Learning Framework for Enhanced Prediction of Synergistic Drug Combinations

JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING 64 : 9 pp. 3689-3705. , 17 p. (2024)

DOI WoS Scopus PubMed Egyéb URL

Közlemény:34843168 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34843168] [Nyilvános]

30.

Pellegrini, M. ✉

Advances in Network-Based Drug Repositioning

LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE 14070 pp. 99-114. , 16 p. (2024)

DOI Scopus

Közlemény:34818057 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34818057] [Nyilvános]

31.

Prasetyo, V.P. ✉ ; Anggraeni, W.

Drug-Target Interactions Prediction Using Stacking Ensemble Learning Approach

In: Yunanto, A.A.; Ramadhani, A.D.; Prayogi, Y.R.; Putra, P.A.M.; Rahmawati, W.M.; Rusli, M.R.; Humaira, F.M.; Nadziroh, F.; Sa'adah, N.; Muna, N.; Rizki, A.B. (szerk.) 26th International Electronics Symposium, IES 2024

Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc. (2024) pp. 681-686. , 6 p.

DOI WoS Scopus

Közlemény:35462332 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Konferenciaközlemény ) Tudományos

Konferenciaközlemény (Könyvrészlet) | Tudományos[35462332] [Nyilvános]

32.

Radha, V. ; Altaff, K. ✉

Bioactive molecules from marine macroalgae for the management of diabetes mellitus with reference to their inhibitory activity: An overview

In: Herbs for Disease Prevention and Treatment

Bentham Science Publishers (2024) pp. 1-24. , 24 p.

DOI Scopus

Közlemény:35692849 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Könyvfejezet ) Tudományos

Könyvfejezet (Könyvrészlet) | Tudományos[35692849] [Nyilvános]

33.

Ren, Tao ; Xu, Yanjie ✉ ; Wang, Pengyu

Identifying influential spreaders in complex network based on the node's weight and spreading probability

INTERNATIONAL JOURNAL OF MODERN PHYSICS C 35 : 11 Paper: 2450142 , 17 p. (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34932526 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34932526] [Nyilvános]

34.

Samman, Waad A. ✉

An overview of polypharmacology: A multifaceted approach to drug development

TROPICAL JOURNAL OF PHARMACEUTICAL RESEARCH 23 : 7 pp. 1215-1224. , 10 p. (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:35295383 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos

Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35295383] [Egyeztetett]

35.

Schrod, Stefan ✉ ; Zacharias, Helena U. ; Beissbarth, Tim ; Hauschild, Anne-Christin ; Altenbuchinger, Michael

CODEX: COunterfactual Deep learning for the in silico EXploration of cancer cell line perturbations

BIOINFORMATICS 40 pp. i91-i99. , 9 p. (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:35295384 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[35295384] [Egyeztetett]

36.

Song, T. ; Zhang, S. ; Meng, X. ; Zhu, Z. ; Zhu, X. ; Wang, X.

DCUI-MGraphDTA: Enabling Efficient Inference of a Drug-Target Binding Affinity Prediction Model on DCUs

In: Cannataro, Mario (szerk.) 2024 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM) : December 3-6, 2024, Lisbon, Portugal : Proceedings

Piscataway (NJ), Amerikai Egyesült Államok : IEEE (2024) pp. 1655-1660. , 6 p.

DOI Scopus

Közlemény:35998771 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Konferenciaközlemény ) Tudományos

Konferenciaközlemény (Könyvrészlet) | Tudományos[35998771] [Nyilvános]

37.

Talevi, A. ✉

Computer-Aided Drug Discovery and Design: Recent Advances and Future Prospects

METHODS IN MOLECULAR BIOLOGY 2714 pp. 1-20. , 20 p. (2024)

DOI Scopus

Közlemény:34823403 Nyilvános Idéző Duplumgyanú Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34823403] [Nyilvános]

38.

Talevi, A. ✉

Computer-Aided Drug Discovery and Design: Recent Advances and Future Prospects

In: Mohini, Gore; Umesh, B. Jagtap (szerk.) Computational Drug Discovery and Design

New York, Amerikai Egyesült Államok : Humana Press (2024) pp. 1-20. , 20 p.

DOI Scopus

Közlemény:35692858 Nyilvános Idéző Duplumgyanú Könyvrészlet (Könyvfejezet ) Tudományos

Könyvfejezet (Könyvrészlet) | Tudományos[35692858] [Nyilvános]

39.

Tendulkar, R. ; Tendulkar, M.

Drug Design and Discovery

In: Computational Biology in Drug Discovery and Repurposing

Apple Academic Press (2024) pp. 363-380. , 18 p.

Scopus

Közlemény:35462336 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Könyvfejezet ) Tudományos

Könyvfejezet (Könyvrészlet) | Tudományos[35462336] [Nyilvános]

40.

Veres, Tamás ; Kerestély, Márk^* ; Kovács, Borbála M. ; Keresztes, Dávid ; Schulc, Klára ; Seitz, Erik ; Vassy, Zsolt ; Veres, Dániel V. ; Csermely, Peter ✉

Cellular forgetting, desensitisation, stress and ageing in signalling networks. When do cells refuse to learn more?

CELLULAR AND MOLECULAR LIFE SCIENCES 81 : 1 Paper: 97 , 13 p. (2024)

DOI WoS Scopus PubMed

Közlemény:34644013 Egyeztetett Forrás Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos

Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34644013] [Egyeztetett]

Nyilvános idéző összesen: 2, Független: 1, Függő: 1, Nem jelölt: 0

41.

Vianello, E. ✉ ; Galliera, E. ✉

New Molecular Mechanisms and Markers in Inflammatory Disorders

INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 25 : 12 Paper: 6506 (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:35118476 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Hozzászólás, helyreigazítás ) Tudományos

Hozzászólás, helyreigazítás (Folyóiratcikk) | Tudományos[35118476] [Nyilvános]

42.

Wang, J. ✉ ; Zhang, Q.

Controllability of Symmetric Double Layer Networks

In: Mohammad, S. Obaidat; Lin, Zhang; Xiaokun, Wang; Chao, Yao; Kuei-Fang, Hsiao; Petros, Nicopolitidis; Yu, Guo (szerk.) Proceedings of the 2024 IEEE International Conference on Communications, Computing, Cybersecurity and Informatics, CCCI 2024

New York, Amerikai Egyesült Államok : IEEE Communications Society (2024) 206 p. Paper: Code 203935

DOI Scopus

Közlemény:35692855 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Konferenciaközlemény ) Tudományos

Konferenciaközlemény (Könyvrészlet) | Tudományos[35692855] [Nyilvános]

43.

Xu, B. ; Bhowmick, S.S. ; Hu, J.

PANACEA: Towards Influence-driven Profiling of Drug Target Combinations in Cancer Signaling Networks

In: Proceedings of the 15th ACM International Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Health Informatics

New York, Amerikai Egyesült Államok : Association for Computing Machinery (ACM) (2024) Paper: 69

DOI Scopus

Közlemény:35998742 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Konferenciaközlemény ) Tudományos

Konferenciaközlemény (Könyvrészlet) | Tudományos[35998742] [Nyilvános]

44.

Zhang, H. ✉ ; Jiao, J. ; Zhao, T. ; Zhao, E. ; Li, L. ; Li, G. ; Zhang, B. ; Qin, Q.-M.

GERWR: Identifying the Key Pathogenicity- Associated sRNAs of Magnaporthe Oryzae Infection in Rice Based on Graph Embedding and Random Walk with Restart

IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS 21 : 2 pp. 227-239. , 13 p. (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34823400 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34823400] [Nyilvános]

45.

Zhou, Z. ; Hu, G. ✉

Applications of graph theory in studying protein structure, dynamics, and interactions

JOURNAL OF MATHEMATICAL CHEMISTRY 62 : 10 pp. 2562-2580. , 19 p. (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34189664 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos

Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34189664] [Nyilvános]

46.

Ziaee, S.S. ; Rahmani, H. ✉ ; Tabatabaei, M. ; Vlot, A.H.C. ; Bender, A.

DCGG: drug combination prediction using GNN and GAE

PROGRESS IN ARTIFICIAL INTELLIGENCE 13 : 1 pp. 17-30. , 14 p. (2024)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34740526 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34740526] [Nyilvános]

47.

Adhikary, T. ; Basak, P. ✉

Software for drug discovery and protein engineering: A comparison between the alternatives and recent advancements in computational biology

In: Neves Cruz, Jorddy (szerk.) Drug Discovery and Design Using Natural Products

Cham, Svájc : Springer Nature Switzerland (2023) 553 p. pp. 241-269. , 29 p.

DOI Scopus

Közlemény:35118604 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Könyvfejezet ) Tudományos

Könyvfejezet (Könyvrészlet) | Tudományos[35118604] [Nyilvános]

48.

Amiri, Souri E. ; Chenoweth, A. ; Karagiannis, S.N. ; Tsoka, S. ✉

Drug repurposing and prediction of multiple interaction types via graph embedding

BMC BIOINFORMATICS 24 : 1 Paper: 202 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33940571 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33940571] [Egyeztetett]

49.

Bojórquez, N.C.Q. ; Campos, M.R.S. ✉

Traditional and Novel Computer-Aided Drug Design (CADD) Approaches in the Anticancer Drug Discovery Process

CURRENT CANCER DRUG TARGETS 23 : 5 pp. 333-345. , 13 p. (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33728576 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos

Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33728576] [Egyeztetett]

50.

Cezar-de-Mello, Paula Fernandes Tavares ; Ryan, Stanthia ; Fichorova, Raina N. ✉

The microRNA Cargo of Human Vaginal Extracellular Vesicles Differentiates Parasitic and Pathobiont Infections from Colonization by Homeostatic Bacteria

MICROORGANISMS 11 : 3 Paper: 551 , 21 p. (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33881255 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33881255] [Egyeztetett]

51.

Chaurasia, P. ; Bhargav, A. ; Ramachandran, S.

Free tools and databases in ligand and structure-based drug design

In: Cheminformatics, QSAR and Machine Learning Applications for Novel Drug Development

Elsevier (2023) pp. 701-727. , 27 p.

DOI Scopus

Közlemény:34189669 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Könyvfejezet ) Tudományos

Könyvfejezet (Könyvrészlet) | Tudományos[34189669] [Nyilvános]

52.

Erenpreisa, Jekaterina ✉ ; Giuliani, Alessandro ; Cragg, Mark Steven

Special Issue "Advances in Genome Regulation in Cancer"

INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 24 : 19 Paper: 14567 , 6 p. (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34268921 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Ismertetés ) Tudományos

Ismertetés (Folyóiratcikk) | Tudományos[34268921] [Egyeztetett]

53.

Ginsberg, S.D. ; Sharma, S. ; Norton, L. ; Chiosis, G. ✉

Targeting stressor-induced dysfunctions in protein–protein interaction networks via epichaperomes

TRENDS IN PHARMACOLOGICAL SCIENCES 44 : 1 pp. 20-33. , 14 p. (2023)

DOI WoS Scopus PubMed

Közlemény:33548190 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos

Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33548190] [Nyilvános]

54.

Gutland, C. ✉

The shift from quantitative to qualitative thinking—problems and prospects as viewed from Husserl’s and Hegel’s philosophy

FRONTIERS IN PSYCHOLOGY 14 Paper: 1232420 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34504155 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34504155] [Nyilvános]

55.

Hattab, G. ✉ ; Anžel, A. ; Spänig, S. ; Neumann, N. ; Heider, D.

A parametric approach for molecular encodings using multilevel atomic neighborhoods applied to peptide classification

NAR GENOMICS AND BIOINFORMATICS 5 : 1 Paper: lqac103 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34189660 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34189660] [Nyilvános]

56.

Ke, D. ; Pu, J. ✉

HEM: An Improved Parametric Link Prediction Algorithm Based on Hybrid Network Evolution Mechanism

ENTROPY 25 : 10 Paper: 1416 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34504146 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34504146] [Egyeztetett]

57.

Khattak, A.A. ; Qian, J. ; Xu, L. ✉ ; Tomah, A.A. ; Ibrahim, E. ; Khan, M.Z.I. ; Ahmed, T. ; Hatamleh, A.A. ; Al-Dosary, M.A. ; Ali, H.M. et al.

Precision drug design against Acidovorax oryzae: leveraging bioinformatics to combat rice brown stripe disease

FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY 13 Paper: 1225285 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34504154 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34504154] [Nyilvános]

58.

Khilwani, R. ; Singh, S. ✉

Systems Biology and Cytokines Potential Role in Lung Cancer Immunotherapy Targeting Autophagic Axis

BIOMEDICINES 11 : 10 Paper: 2706 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34504147 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos

Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34504147] [Egyeztetett]

59.

Li, TH ; Wang, CC ; Zhang, L ; Chen, X

SNRMPACDC: computational model focused on Siamese network and random matrix projection for anticancer synergistic drug combination prediction

BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS 24 : 1 Paper: bbac503 , 9 p. (2023)

DOI WoS Scopus PubMed

Közlemény:33425360 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33425360] [Egyeztetett]

60.

Li, Wenrong ; Li, Haitao ✉ ; Yang, Xinrong

Edge removal towards asymptotical stabilizability of Boolean networks under asynchronous stochastic update

SYSTEMS & CONTROL LETTERS 181 Paper: 105639 , 7 p. (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34268920 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34268920] [Egyeztetett]

61.

Li, X. ; Yang, Q. ; Luo, G. ✉ ; Xu, L. ; Dong, W. ; Wang, W. ; Dong, S. ; Wang, K. ✉ ; Xuan, P. ; Gao, X.

SAGDTI: self-attention and graph neural network with multiple information representations for the prediction of drug–target interactions

Bioinformatics Advances 3 : 1 Paper: vbad116 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34740537 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34740537] [Nyilvános]

62.

Li, Zhe ✉ ; Huang, Xinyu ✉

Identifying Influential Spreaders Using Local Information

MATHEMATICS 11 : 6 Paper: 1302 , 14 p. (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33881254 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33881254] [Egyeztetett]

63.

Luo, L. ; Wang, J. Y. ; Xiong, A. Y. ; Liu, J. L. ; Liu, Y. ; Liu, S. B. ; Xiong, Y. ✉ ; He, X. ✉ ; Li, G. P. ✉

Decoding the Mechanism of Magnolol in Treating Asthma Based on Network Pharmacology and Transcriptomic Analysis

INDIAN JOURNAL OF PHARMACEUTICAL SCIENCES 85 : 5 pp. 1373-1387. , 15 p. (2023)

WoS

Közlemény:34668646 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34668646] [Egyeztetett]

64.

Mangione, William ; Falls, Zackary ; Samudrala, Ram ✉

Effective holistic characterization of small molecule effects using heterogeneous biological networks

FRONTIERS IN PHARMACOLOGY 14 Paper: 1113007 , 16 p. (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33881252 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33881252] [Egyeztetett]

65.

Mathews, J. ; Chang, A.J. ; Devlin, L. ; Levin, M. ✉

Cellular signaling pathways as plastic, proto-cognitive systems: Implications for biomedicine

Patterns 4 : 5 Paper: 100737 (2023)

DOI WoS Scopus PubMed Teljes dokumentum

Közlemény:33908150 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos

Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33908150] [Egyeztetett]

66.

Nussinov, R. ✉ ; Liu, Y. ; Zhang, W. ; Jang, H.

Protein conformational ensembles in function: roles and mechanisms

RSC CHEMICAL BIOLOGY 4 : 11 pp. 850-864. , 15 p. (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34416227 Nyilvános Idéző Duplumgyanú Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos

Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34416227] [Nyilvános]

67.

Pensotti, A. ✉ ; Bertolaso, M. ; Bizzarri, M.

Is Cancer Reversible? Rethinking Carcinogenesis Models—A New Epistemological Tool

BIOMOLECULES 13 : 5 Paper: 733 (2023)

DOI WoS Scopus PubMed

Közlemény:34061580 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos

Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34061580] [Egyeztetett]

68.

Rajeh, S. ; Cherifi, H.

A community-aware centrality framework based on overlapping modularity

SOCIAL NETWORK ANALYSIS AND MINING 13 : 1 Paper: 37 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33706266 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33706266] [Egyeztetett]

69.

Recanatini, M. ✉ ; Menestrina, L.

Network modeling helps to tackle the complexity of drug–disease systems

WIRES MECHANISMS OF DISEASE 15 : 4 Paper: e1607 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33728573 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33728573] [Nyilvános]

70.

Sarmah, Deepraj ; Meredith, Wesley O. ; Weber, Ian K. ; Price, Madison R. ; Birtwistle, Marc R. ✉

Predicting anti-cancer drug combination responses with a temporal cell state network model

PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY 19 : 5 Paper: e1011082 , 20 p. (2023)

DOI WoS Scopus PubMed

Közlemény:33881251 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33881251] [Nyilvános]

71.

Schön, J.C. ✉

Energy landscapes in inorganic chemistry

In: Reedijk, J; Poeppelmeier, KR (szerk.) Comprehensive Inorganic Chemistry III, Third Edition

Amsterdam, Hollandia : Elsevier (2023) pp. 262-392. , 131 p.

DOI Scopus

Közlemény:33940581 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Könyvfejezet ) Tudományos

Könyvfejezet (Könyvrészlet) | Tudományos[33940581] [Nyilvános]

72.

Sharma, S. ; Kumaravel, J. ; Kaur, G. ; Prakash, A. ; Medhi, B.

Target identification for potential drug discovery

In: Computational Approaches in Drug Discovery, Development and Systems Pharmacology

Elsevier (2023) pp. 183-196. , 14 p.

DOI Scopus

Közlemény:33940578 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Könyvfejezet ) Tudományos

Könyvfejezet (Könyvrészlet) | Tudományos[33940578] [Nyilvános]

73.

Sinaimeri, Blerina ; Marino, Andrea ; Tronci, Enrico ; Calamoneri, Tiziana ✉

STARGATE-X: a Python package for statistical analysis on the REACTOME network

Journal of Integrative Bioinformatics 20 : 3 Paper: 20220029 , 16 p. (2023)

DOI WoS

Közlemény:34268922 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34268922] [Nyilvános]

74.

Sun, J. ✉ ; Xu, M. ; Ru, J. ; James-Bott, A. ; Xiong, D. ; Wang, X. ✉ ; Cribbs, A.P. ✉

Small molecule-mediated targeting of microRNAs for drug discovery: Experiments, computational techniques, and disease implications

EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY 257 Paper: 115500 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34061578 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Összefoglaló cikk ) Tudományos

Összefoglaló cikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34061578] [Nyilvános]

75.

Tang, Chunyan ; Zhong, Cheng ✉ ; Wang, Mian ; Zhou, Fengfeng

FMGNN: A Method to Predict Compound-Protein Interaction With Pharmacophore Features and Physicochemical Properties of Amino Acids

IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS 20 : 2 pp. 1030-1040. , 11 p. (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33881253 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33881253] [Egyeztetett]

76.

Vallianatou, T. ; Tsopelas, F. ; Tsantili-Kakoulidou, A.

Modeling ADMET properties based on biomimetic chromatographic data

In: Cheminformatics, QSAR and Machine Learning Applications for Novel Drug Development

Elsevier (2023) pp. 573-607. , 35 p.

DOI Scopus

Közlemény:34189672 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Könyvfejezet ) Tudományos

Könyvfejezet (Könyvrészlet) | Tudományos[34189672] [Nyilvános]

77.

Xu, M. ; Zhao, X. ; Wang, J. ; Feng, W. ; Wen, N. ; Wang, C. ; Wang, J. ; Liu, Y. ✉ ; Zhao, L. ✉

DFFNDDS: prediction of synergistic drug combinations with dual feature fusion networks

JOURNAL OF CHEMINFORMATICS 15 : 1 Paper: 33 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33728566 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33728566] [Egyeztetett]

78.

Yan, J. ; Zheng, Z. ✉

Discovery of Highly Potent CRBN Ligands and Insight into Their Binding Mode through Molecular Docking and Molecular Dynamics Simulations

CHEMMEDCHEM 18 : 5 Paper: 202200573 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33728568 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33728568] [Nyilvános]

79.

Ye, Q. ; Yan, G. ✉ ; Chang, W. ; Luo, H.

Vital node identification based on cycle structure in a multiplex network

EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL B 96 : 2 Paper: 15 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33728571 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33728571] [Nyilvános]

80.

Yi, B. ; Sun, J. ✉ ; Liu, Y. ; Zhang, Z. ; Wang, R. ; Shu, M. ; Lin, Z.

Virtual Screening and Multi-targets Investigation of Novel Diazine Derivatives as Potential Xanthine Oxidase Inhibitors Based on QSAR, Molecular Docking, ADMET Properties, Dynamics Simulation and Network Pharmacology

MEDICINAL CHEMISTRY 19 : 7 pp. 704-716. , 13 p. (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34061592 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34061592] [Nyilvános]

81.

Yue, Yang ; Liu, Yongxuan ; Hao, Luoying ; Lei, Huangshu ; He, Shan ✉

Improving therapeutic synergy score predictions with adverse effects using multi-task heterogeneous network learning

BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS 24 : 1 Paper: bbac564 , 11 p. (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33881256 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33881256] [Nyilvános]

82.

Yu, H. ✉ ; Mooney, M.

Characterizing the as-encountered ground condition with tunnel boring machine data using semi-supervised learning

COMPUTERS AND GEOTECHNICS 154 Paper: 105159 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33728572 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33728572] [Egyeztetett]

83.

Zhang, M. ; Zhang, Z. ; Zhang, N. ✉

Evaluation of Critical Sectors in the Intersectoral Embodied Carbon Emission Transfer Network in Jiangsu Province

International Journal of Nonlinear Science 36 : 2-3 pp. 38-42. , 5 p. (2023)

Scopus

Közlemény:34740532 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34740532] [Nyilvános]

84.

Zhang, Z. ; Wang, Q. ✉ ; Tao, Z. ; Gao, Q. ; Feng, W.

Dropping Pathways Towards Deep Multi-View Graph Subspace Clustering Networks

In: Proceedings of the 31st ACM International Conference on Multimedia

New York, Amerikai Egyesült Államok : Association for Computing Machinery (ACM) (2023) pp. 3259-3267. , 9 p.

DOI WoS Scopus

Közlemény:34504142 Egyeztetett Idéző Könyvrészlet (Konferenciaközlemény ) Tudományos

Konferenciaközlemény (Könyvrészlet) | Tudományos[34504142] [Egyeztetett]

85.

Zhou, T.

Discriminating abilities of threshold-free evaluation metrics in link prediction

PHYSICA A - STATISTICAL MECHANICS AND ITS APPLICATIONS 615 Paper: 128529 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33728567 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33728567] [Egyeztetett]

86.

Zhu, S. ✉ ; Zhan, J. ✉ ; Li, X.

Identifying influential nodes in complex networks using a gravity model based on the H-index method

SCIENTIFIC REPORTS 13 : 1 Paper: 16404 (2023)

DOI WoS Scopus

Közlemény:34504139 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[34504139] [Nyilvános]

87.

Aguti, R. ; Gardini, E. ; Bertazzo, M. ; Decherchi, S. ✉ ; Cavalli, A.

Probabilistic Pocket Druggability Prediction via One-Class Learning

FRONTIERS IN PHARMACOLOGY 13 Paper: 870479 (2022)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33052298 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33052298] [Egyeztetett]

88.

Bálint, Mónika ; Zsidó, Balázs Zoltán^* ; van der Spoel, David ; Hetényi, Csaba ✉

Binding Networks Identify Targetable Protein Pockets for Mechanism-Based Drug Design

INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 23 : 13 Paper: 7313 , 15 p. (2022)

DOI WoS REAL Scopus PubMed

Zárolt Közlemény:32916822 Egyeztetett Forrás Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[32916822] [Egyeztetett]

Nyilvános idéző összesen: 1, Független: 1, Függő: 0, Nem jelölt: 0

89.

Barros, Daniel Bezerra ✉ ; Giaducianni, Carlo ; Herrera, Manuel ; Di, Nardo Armando ; Brentan, Bruno

Pressure Sensors Placement Using Graph Signal Processing and Sampling Theory

In: Miguel, Ortega-Sánchez (szerk.) Proceedings of the 39th IAHR World Congress – IAHR 2022

Madrid, Spanyolország : International Association for Hydro-Environment Engineering and Research (IAHR) (2022) 7,276 p. pp. 1913-1921. , 9 p.

DOI WoS Scopus

Közlemény:34906206 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Konferenciaközlemény ) Tudományos

Konferenciaközlemény (Könyvrészlet) | Tudományos[34906206] [Nyilvános]

90.

Bi, Yilin ; Wang, Pei ✉

Exploring drought-responsive crucial genes in Sorghum

ISCIENCE 25 : 11 Paper: 105347 , 21 p. (2022)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33409219 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33409219] [Egyeztetett]

91.

Bustamante, C. ; Muskus, C. ; Ochoa, R. ✉

Rational computational approaches to predict novel drug candidates against leishmaniasis

ANNUAL REPORTS IN MEDICINAL CHEMISTRY 59 pp. 137-187. , 51 p. (2022)

DOI Scopus

Közlemény:33166078 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33166078] [Nyilvános]

92.

Bustamante, C. ; Muskus, C. ; Ochoa, R. ✉

Rational computational approaches to predict novel drug candidates against leishmaniasis

In: Caballero, Julio (szerk.) Virtual Screening and Drug Docking : ANNUAL REPORTS IN MEDICINAL CHEMISTRY, 59

Amsterdam, Hollandia : Elsevier (2022) pp. 137-187. , 51 p.

DOI WoS Scopus

Közlemény:35118699 Nyilvános Idéző Könyvrészlet (Könyvfejezet ) Tudományos

Könyvfejezet (Könyvrészlet) | Tudományos[35118699] [Nyilvános]

93.

Cetin, A. ✉ ; Toptas, M. ; Türkan, F.

Synthesis, biological evaluation, and bioinformatics analysis of indole analogs on AChE and GST activities

MEDICINAL CHEMISTRY RESEARCH 31 : 12 pp. 2119-2131. , 13 p. (2022)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33166080 Nyilvános Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33166080] [Nyilvános]

94.

Chen, Yuhao ; Hu, Yanshi ; Hu, Xiaotian ; Feng, Cong ; Chen, Ming ✉

CoGO: a contrastive learning framework to predict disease similarity based on gene network and ontology structure

BIOINFORMATICS 38 : 18 pp. 4380-4386. , 7 p. (2022)

DOI WoS Scopus

Közlemény:33186463 Egyeztetett Idéző Folyóiratcikk (Szakcikk ) Tudományos

Szakcikk (Folyóiratcikk) | Tudományos[33186463] [Egyeztetett]

95.

Csabai, Luca ; Fazekas, Dávid^* ; Kadlecsik, Tamás^* ; Szalay-Bekő, Máté ; Bohár, Balázs ; Madgwick, Matthew ; Módos, Dezső ; Ölbei, Márton ; Gul, Lejla ; Sudhakar, Padhmanand et al.

SignaLink3: a multi-layered resource to uncover tissue-specific signaling networks

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 50 : D1 pp. D701-D709. , 9 p. (2022)