TY - JOUR AU - Pikó, Henriett AU - Illés, Anett AU - Nagy, Sándor AU - Beke, Artúr AU - Árvai, Kristóf AU - Elekes, Tibor AU - Ferdinandyné Horváth, Emese AU - Ferenczy, Miklós AU - Mosonyi, Péter AU - Lukács, Valéria AU - Klujber, Valéria AU - Török, Olga AU - Kiss, Zsuzsanna AU - P Tardy, Erika AU - Tidrenczel, Zsolt AU - Tóbiás, Bálint AU - Balla, Bernadett AU - Lakatos, Péter AU - Kósa, János AU - Takács, István TI - Az első hazai tapasztalatok összegzése kromoszomális microarray-analízis és teljesexom-szekvenálás módszerekkel a magzati diagnosztikában JF - ORVOSI HETILAP J2 - ORV HETIL VL - 165 PY - 2024 IS - 14 SP - 523 EP - 530 PG - 8 SN - 0030-6002 DO - 10.1556/650.2024.33028 UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/34780698 ID - 34780698 AB - Bevezetés: Az elmúlt évtized egyik jelentős technológiai újdonsága az ún. ’high-throughput’ molekuláris genetikai vizsgálati módszerek – mint a kromoszomális microarray-analízis (chromosomal microarray analysis, CMA) és a teljesexom-szekvenálás (whole-exome sequencing, WES) – elterjedése a praenatalis diagnosztikában. Célkitűzés: Az elmúlt 5 évben munkacsoportunk több mint 252 praenatalis vizsgálatot végzett hazai laboratóriumi háttérrel, amelyek indikációját különböző súlyosságú strukturális magzati ultrahangeltérések képezték. A klasszikus citogenetikai vizsgálatok eredményétől függően végeztük el a nagy felbontású CMA- és WES-analíziseket a praenatalis diagnosztika érdekében. Módszer: A CMA-vizsgálatokat a „GeneChip System 3000 Instrument” platformmal végeztük az SNP-alapú komparatív hibridizálás módszerével. Az általunk elvégzett újgenerációs szekvenálás során a teljes humán exom szekvenciájának meghatározása IonTorrent és Illumina platformokkal történt. Eredmények: Összesen 252 magzati CMA-vizsgálatot végeztünk, és 42%-ban mutattunk ki valamilyen hiányt vagy többletet, ebből 22%-ban igazoltunk kóros eltérést. 42 esetben végeztünk WES-t, amelyből 9 esetben (21,4%) azonosítottunk kóros eltérést az öröklésmenetet támogató, a magzati fenotípussal feltételezhetően összefüggésben lévő, a ClinVar adatbázis vagy az ACMG-klasszifikáció alapján. Megbeszélés: Tekintettel arra, hogy a magzati fenotípus értékelése közvetett, a praenatalis CMA- és WES-elemzésnek elsősorban a magzati ultrahangvizsgálat során azonosítható strukturális anomáliákkal összefüggő génekre, kromoszomális régiókra kell korlátozódnia. A szülők vizsgálata mind a CMA-, mind a WES-analízisek során kiemelt jelentőséggel bír, főleg azokban az esetekben, amelyeknél a kapott eltérés nem hozható egyértelmű összefüggésbe az ultrahangeltérésekkel. Következtetés: Fontos meghatározni azokat a paramétereket, amelyek alapján a magzati mintában talált kópiaszám-eltéréseket és WES-vizsgálattal igazolt variánsokat a leletben közöljük (figyelembe véve a nemzetközi ajánlásokat). Ezek alapján a praenatalis klinikai genetikai tanácsadáskor sokkal használhatóbb információk adhatók. Orv Hetil. 2024; 165(14): 523–530. LA - Hungarian DB - MTMT ER - TY - CONF AU - Horváth, Orsolya AU - Török, Rita AU - Klivényi, Péter TI - The role of SIRT3 in cerebral ischemia and its effect on sirtuin expression T2 - International Neuroscience Conference, Pécs 2024 PY - 2024 SP - 59 UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/34734191 ID - 34734191 LA - English DB - MTMT ER - TY - JOUR AU - Bokor, Barbara Anna AU - Török, Dóra AU - Ferdinandyné Horváth, Emese AU - László, Zsuzsanna AU - Pál, Margit AU - Szűcs, Péter AU - Széll, Márta TI - MECP2-gén-duplikáció gyermekkori és praenatalis diagnózisa JF - ORVOSI HETILAP J2 - ORV HETIL VL - 165 PY - 2024 IS - 1 SP - 30 EP - 34 PG - 5 SN - 0030-6002 DO - 10.1556/650.2024.32956 UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/34683151 ID - 34683151 AB - A MECP2 -duplikációs szindróma (Lubs-féle mentális fejlődési zavar) X-kromoszómához kötött öröklődésmenetet mutató ritka kórállapot, amely hemizigóta fiúkban mindig előidéz klinikai tüneteket, míg az eltérést hordozó nők általában tünetmentesek, bár ritkán a nőkben is kialakulhatnak változatos súlyosságú tünetek. Az általunk vizsgált 6 éves leány genetikai konzíliumát mozgás- és beszédfejlődésben észlelt elmaradás miatt kérte a gyermekneurológus szakorvos. A proband kislány kromoszómavizsgálata normál női karyotypust mutatott. A P245 microdeletiós szindrómára specifikus 1A-próbamixszel végzett multiplex ligatiofüggő próbaamplifikációs (MLPA-) vizsgálat az Xq28 kromoszomális régióban a MECP2-4b, MECP2-3, valamint MECP2-1 próbák területén heterozigóta duplikációt jelzett. Az Xq28 kromoszomális régióra specifikus fluoreszcens in situ hibridizációs (FISH-) vizsgálat során nem tapasztaltunk duplikációt. A családtagok közül a beteg egészséges leánytestvére és édesapja, valamint leány féltestvére nem bizonyult MLPA-vizsgálattal MECP2 -duplikációsnak. A tüneteket mutató édesanyánál a proband genotípusával megegyező eltérést azonosítottunk. Az édesanya újabb párkapcsolatából fogant várandósságában elvégzett magzati MLPA-vizsgálat a fiúmagzatban kimutatta a családban azonosított MECP2 -duplikációt, a kariotipizálás pedig 21-triszómiát mutatott. A várandós nő a két egymástól független magzati kórállapot miatt kérte a terhesség megszakítását. Az általunk bemutatott eset tanulsága, hogy nem tisztázott fejlődési elmaradással jelentkező páciensek esetén a G-sáv-technikával elvégzett karyotypus-elemzés megfelelő MLPA-vizsgálattal történő kiegészítése segíthet a genotípus-fenotípus összefüggések felállításában és genetikai diagnózis esetén a praenatalis diagnosztika megszervezésében. Orv Hetil. 2024; 165(1): 30–34. LA - Hungarian DB - MTMT ER - TY - JOUR AU - Nagy, Zsófia Flóra AU - Pál, Margit AU - Engelhardt, József István AU - Molnár, Mária Judit AU - Klivényi, Péter AU - Széll, Márta TI - Beyond C9orf72: repeat expansions and copy number variations as risk factors of amyotrophic lateral sclerosis across various populations JF - BMC MEDICAL GENOMICS J2 - BMC MED GENOMICS VL - 17 PY - 2024 IS - 1 PG - 8 SN - 1755-8794 DO - 10.1186/s12920-024-01807-9 UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/34543229 ID - 34543229 LA - English DB - MTMT ER - TY - JOUR AU - Nagy, Nikoletta AU - Pál, Margit AU - Kun, József AU - Gálik, Bence AU - Urban, Peter AU - Medvecz, Márta AU - Fabos, Beata AU - Neller, Alexandra AU - Abdolreza, Aliasgari AU - Danis, Judit AU - Szabó, Viktória AU - Yang, Zhuo AU - Fenske, Stefanie AU - Biel, Martin AU - Gyenesei, Attila AU - Ádám, Éva AU - Széll, Márta TI - Missing Heritability in Albinism: Deep Characterization of a Hungarian Albinism Cohort Raises the Possibility of the Digenic Genetic Background of the Disease JF - INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES J2 - INT J MOL SCI VL - 25 PY - 2024 IS - 2 PG - 10 SN - 1661-6596 DO - 10.3390/ijms25021271 UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/34531433 ID - 34531433 AB - Albinism is characterized by a variable degree of hypopigmentation affecting the skin and the hair, and causing ophthalmologic abnormalities. Its oculocutaneous, ocular and syndromic forms follow an autosomal or X-linked recessive mode of inheritance, and 22 disease-causing genes are implicated in their development. Our aim was to clarify the genetic background of a Hungarian albinism cohort. Using a 22-gene albinism panel, the genetic background of 11 of the 17 Hungarian patients was elucidated. In patients with unidentified genetic backgrounds (n = 6), whole exome sequencing was performed. Our investigations revealed a novel, previously unreported rare variant (N687S) of the two-pore channel two gene (TPCN2). The N687S variant of the encoded TPC2 protein is carried by a 15-year-old Hungarian male albinism patient and his clinically unaffected mother. Our segregational analysis and in vitro functional experiments suggest that the detected novel rare TPCN2 variant alone is not a disease-causing variant in albinism. Deep genetic analyses of the family revealed that the patient also carries a phenotype-modifying R305W variant of the OCA2 protein, and he is the only family member harboring this genotype. Our results raise the possibility that this digenic combination might contribute to the observed differences between the patient and the mother, and found the genetic background of the disease in his case. LA - English DB - MTMT ER - TY - JOUR AU - Nagy, Nikoletta AU - Pál, Margit AU - Nagy, Dóra AU - Bokor, Barbara Anna AU - Zimmermann, Aliz AU - Gellén, Balázs AU - Salamon, András AU - Sztriha, László AU - Klivényi, Péter AU - Széll, Márta TI - A novel de novo truncating variant in a Hungarian patient with CTNNB1 neurodevelopmental disorder JF - BMC PEDIATRICS J2 - BMC PEDIATR VL - 24 PY - 2024 IS - 1 PG - 6 SN - 1471-2431 DO - 10.1186/s12887-023-04509-w UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/34505540 ID - 34505540 AB - We aimed to elucidate the underlying disease in a Hungarian family, with only one affected family member, a 16-year-old male Hungarian patient, who developed global developmental delay, cognitive impairment, behavioral problems, short stature, intermittent headaches, recurrent dizziness, strabismus, hypermetropia, complex movement disorder and partial pituitary dysfunction. After years of detailed clinical investigations and careful pediatric care, the exact diagnosis of the patient and the cause of the disease was still unknown.We aimed to perform whole exome sequencing (WES) in order to investigate whether the affected patient is suffering from a rare monogenic disease.Using WES, we identified a novel, de novo frameshift variant (c.1902dupG, p.Ala636SerfsTer12) of the catenin beta-1 (CTNNB1) gene. Assessment of the novel CTNNB1 variant suggested that it is a likely pathogenic one and raised the diagnosis of CTNNB1 neurodevelopmental disorder (OMIM 615,075).Our manuscript may contribute to the better understanding of the genetic background of the recently discovered CTNNB1 neurodevelopmental disorder and raise awareness among clinicians and geneticists. The affected Hungarian family demonstrates that based on the results of the clinical workup is difficult to establish the diagnosis and high-throughput genetic screening may help to solve these complex cases. LA - English DB - MTMT ER - TY - GEN AU - Nagy, Nikoletta AU - Pál, Margit AU - Neller, Alexandra AU - Judit, Danis AU - Ádám, Éva AU - Széll, Márta TI - Fenotípus módosító faktorok ritka betegségekben CY - Szervező: RIROSZ (Ritka és Veleszületett Rendellenességgel Élők Szövetsége), 60 tagszervezete és a Semmelweis Egyetem PY - 2023 UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/34761280 ID - 34761280 LA - Hungarian DB - MTMT ER - TY - GEN AU - Nagy, Nikoletta TI - Genotipus-fenotipus összefüggések feltá­rása és funkcionális vizsgálatok CYLD kután szindrómában CY - Szeged, 2023. október 25 – 27. PY - 2023 UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/34761074 ID - 34761074 LA - Hungarian DB - MTMT ER - TY - CONF AU - Nagy, Nikoletta AU - Pál, Margit AU - Kun, József AU - Gálik, Bence AU - Urbán, Péter AU - Fábos, Beáta AU - Neller, Alexandra AU - Danis, Judit AU - Ádám, Éva AU - Gyenesei, Attila AU - Széll, Márta TI - Epigenetikai vizsgálatok a fenotípusbeli variabilitás hátterében álló különbségek azonosítására T2 - A Magyar Humángenetikai és Genomikai Társaság XIV. Kongresszusa PY - 2023 SP - 1 UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/34761045 ID - 34761045 LA - Hungarian DB - MTMT ER - TY - CONF AU - Pál, Margit AU - Nagy, Dóra AU - Neller, Alexandra AU - Farkas, Katalin AU - Leprán-Török, Dóra AU - Nagy, Nikoletta AU - Füstös, Dalma AU - Nagy, Roland AU - Rovó, László AU - Kis, József Géza AU - Széll, Márta TI - A nemszindrómás hallásvesztés genetikai hátterének meghatározása kohleáris implantátummal rendelkező Magyarországi populációban T2 - A Magyar Humángenetikai és Genomikai Társaság XIV. Kongresszusa PY - 2023 SP - 1 UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/34761041 ID - 34761041 LA - Hungarian DB - MTMT ER -