@mastersthesis{MTMT:34108181,
	title = {A Histone H4 replacement (H4r) gén funkciójának vizsgálata Drosophila melanogasterben [Investigation of the function of the Histone H4 replacement (H4r) gene in Drosophila melanogaster]},
	url = {https://m2.mtmt.hu/api/publication/34108181},
	author = {Ábrahám, Andrea},
	doi = {10.14232/phd.11405},
	publisher = {Universití of Szeged},
	unique-id = {34108181},
	abstract = {Eukarióta sejtekben a DNS sejtmagba történő becsomagolását a hiszton fehérjék végzik. A hisztonok és DNS komplexeként létrejövő kromatin kondenzációján keresztül ezek a fehérjék a genom stabilitásáért és a génműködés szabályozásáért felelősek. A DNS replikációjához kötötten kifejeződő kanonikus hisztonok minden sejtben megtalálhatók és poszt-transzlációs módosításaiktól függő módon vesznek részt az érintett régiók működésének szabályozásában. Ezzel szemben a replikációfüggetlen expressziójú hiszton variánsok a génexpresszió szabályozásában specifikus funkciókkal rendelkeznek, és mutathatnak sejttípusspecifikus expressziót. A Drosophila melanogaster kanonikus hiszton génjei egy klaszterben helyezkednek magas kópiaszámban. Ezzel szemben a hiszton variánsok a hiszton klaszteren kívül helyezkednek el a genomban, egy példányban, szerkezetükben általában kissé eltérnek kanonikus megfelelőiktől, specifikus szabályozásuk pedig lehetővé teszi specifikus szöveti vagy differenciálódási funkciók ellátását. A többi alternatív hisztontól eltérően a H4 variáns fehérje (H4r) aminosavsorrendje megegyezik a kanonikus H4-ével. Annak érdekében, hogy a H4r-t megkülönböztethessük a kanonikus H4-től és információt nyerhessünk a szerepéről, epitóp-jelöltük a H4r-t, tanulmányoztuk annak térbeli és időbeli kifejeződését, és feltártuk a kromatinban való lokalizációját nukleoszomális szinten. Immunhisztokémiai vizsgálatok alapján a H4r általánosan kifejeződik az embrionális és lárvális fejlődési állapotokban, de a fejlődő idegrendszerben, a H4r expressziója tekintetében enyhe eltérések figyelhetők meg az egyes sejttípusok között, a H4r az agyi sejtek egy kisebb populációjában felhalmozódást mutat, mely nem korlátozódik sejttípusra vagy differenciációs stádiumra. ChIP-seq kísérletekkel kimutattuk, hogy a H4r lokalizációja preferenciális összefüggést mutat a szabályozó régiókkal, különösen a sejtek stresszre adott válaszaiban részt vevő gének esetén. Mindent összevetve a kísérleti adatok azt jelzik, hogy a H4r-nek van a kanonikus H4-től eltérő, specifikus variáns hiszton funkciója, amellyel hozzájárulhat a nem osztódó sejtek transzkripciós memóriájának kialakításához.},
	year = {2023}
}

@article{MTMT:32741372,
	title = {Despite its sequence identity with canonical H4, Drosophila H4r product is enriched at specific chromatin regions},
	url = {https://m2.mtmt.hu/api/publication/32741372},
	author = {Ábrahám, Andrea and Villanyi, Zoltan and Zsindely, Nóra and Nagy, Gábor and Szabó, Áron and Bodai, László and Henn, László and Boros, Imre Miklós},
	doi = {10.1038/s41598-022-09026-x},
	journal-iso = {SCI REP},
	journal = {SCIENTIFIC REPORTS},
	volume = {12},
	unique-id = {32741372},
	abstract = {Histone variants are different from their canonical counterparts in structure and are encoded by solitary genes with unique regulation to fulfill tissue or differentiation specific functions. A single H4 variant gene (<jats:italic>His4r</jats:italic> or <jats:italic>H4r</jats:italic>) that is located outside of the histone cluster and gives rise to a polyA tailed messenger RNA via replication-independent expression is preserved in <jats:italic>Drosophila</jats:italic> strains despite that its protein product is identical with canonical H4. In order to reveal information on the possible role of this alternative H4 we epitope tagged endogenous H4r and studied its spatial and temporal expression, and revealed its genome-wide localization to chromatin at the nucleosomal level. RNA and immunohistochemistry analysis of <jats:italic>H4r</jats:italic> expressed under its cognate regulation indicate expression of the gene throughout zygotic and larval development and presence of the protein product is evident already in the pronuclei of fertilized eggs. In the developing nervous system a slight disequibrium in H4r distribution is observable, cholinergic neurons are the most abundant among H4r-expressing cells. ChIP-seq experiments revealed  H4r association with regulatory regions of genes involved in cellular stress response. The data presented here indicate that H4r has a variant histone function.},
	year = {2022},
	eissn = {2045-2322},
	orcid-numbers = {Zsindely, Nóra/0000-0002-6189-3100; Nagy, Gábor/0000-0001-5464-1135; Bodai, László/0000-0001-8411-626X; Boros, Imre Miklós/0000-0001-8504-9687}
}

@article{MTMT:31397830,
	title = {Alternative linker histone permits fast paced nuclear divisions in early Drosophila embryo},
	url = {https://m2.mtmt.hu/api/publication/31397830},
	author = {Henn, László and Szabó, Anikó and Imre, László and Román, Ádám and Ábrahám, Andrea and Vedelek, Balázs and Nánási, Péter Pál and Boros, Imre Miklós},
	doi = {10.1093/nar/gkaa624},
	journal-iso = {NUCLEIC ACIDS RES},
	journal = {NUCLEIC ACIDS RESEARCH},
	volume = {48},
	unique-id = {31397830},
	issn = {0305-1048},
	abstract = {In most animals, the start of embryogenesis requires specific histones. In Drosophila linker histone variant BigH1 is present in early embryos. To uncover the specific role of this alternative linker histone at early embryogenesis, we established fly lines in which domains of BigH1 have been replaced partially or completely with that of H1. Analysis of the resulting Drosophila lines revealed that at normal temperature somatic H1 can substitute the alternative linker histone, but at low temperature the globular and C-terminal domains of BigH1 are essential for embryogenesis. In the presence of BigH1 nucleosome stability increases and core histone incorporation into nucleosomes is more rapid, while nucleosome spacing is unchanged. Chromatin formation in the presence of BigH1 permits the fast-paced nuclear divisions of the early embryo. We propose a model which explains how this specific linker histone ensures the rapid nucleosome reassembly required during quick replication cycles at the start of embryogenesis.},
	year = {2020},
	eissn = {1362-4962},
	pages = {9007-9018},
	orcid-numbers = {Román, Ádám/0000-0003-2007-3269; Vedelek, Balázs/0000-0001-6981-0026; Boros, Imre Miklós/0000-0001-8504-9687}
}