TY - THES AU - Ábrahám, Andrea TI - A Histone H4 replacement (H4r) gén funkciójának vizsgálata Drosophila melanogasterben [Investigation of the function of the Histone H4 replacement (H4r) gene in Drosophila melanogaster] PB - Szegedi Tudományegyetem PY - 2023 SP - 80 DO - 10.14232/phd.11405 UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/34108181 ID - 34108181 AB - Eukarióta sejtekben a DNS sejtmagba történő becsomagolását a hiszton fehérjék végzik. A hisztonok és DNS komplexeként létrejövő kromatin kondenzációján keresztül ezek a fehérjék a genom stabilitásáért és a génműködés szabályozásáért felelősek. A DNS replikációjához kötötten kifejeződő kanonikus hisztonok minden sejtben megtalálhatók és poszt-transzlációs módosításaiktól függő módon vesznek részt az érintett régiók működésének szabályozásában. Ezzel szemben a replikációfüggetlen expressziójú hiszton variánsok a génexpresszió szabályozásában specifikus funkciókkal rendelkeznek, és mutathatnak sejttípusspecifikus expressziót. A Drosophila melanogaster kanonikus hiszton génjei egy klaszterben helyezkednek magas kópiaszámban. Ezzel szemben a hiszton variánsok a hiszton klaszteren kívül helyezkednek el a genomban, egy példányban, szerkezetükben általában kissé eltérnek kanonikus megfelelőiktől, specifikus szabályozásuk pedig lehetővé teszi specifikus szöveti vagy differenciálódási funkciók ellátását. A többi alternatív hisztontól eltérően a H4 variáns fehérje (H4r) aminosavsorrendje megegyezik a kanonikus H4-ével. Annak érdekében, hogy a H4r-t megkülönböztethessük a kanonikus H4-től és információt nyerhessünk a szerepéről, epitóp-jelöltük a H4r-t, tanulmányoztuk annak térbeli és időbeli kifejeződését, és feltártuk a kromatinban való lokalizációját nukleoszomális szinten. Immunhisztokémiai vizsgálatok alapján a H4r általánosan kifejeződik az embrionális és lárvális fejlődési állapotokban, de a fejlődő idegrendszerben, a H4r expressziója tekintetében enyhe eltérések figyelhetők meg az egyes sejttípusok között, a H4r az agyi sejtek egy kisebb populációjában felhalmozódást mutat, mely nem korlátozódik sejttípusra vagy differenciációs stádiumra. ChIP-seq kísérletekkel kimutattuk, hogy a H4r lokalizációja preferenciális összefüggést mutat a szabályozó régiókkal, különösen a sejtek stresszre adott válaszaiban részt vevő gének esetén. Mindent összevetve a kísérleti adatok azt jelzik, hogy a H4r-nek van a kanonikus H4-től eltérő, specifikus variáns hiszton funkciója, amellyel hozzájárulhat a nem osztódó sejtek transzkripciós memóriájának kialakításához. LA - Hungarian DB - MTMT ER - TY - JOUR AU - Ábrahám, Andrea AU - Villanyi, Zoltan AU - Zsindely, Nóra AU - Nagy, Gábor AU - Szabó, Áron AU - Bodai, László AU - Henn, László AU - Boros, Imre Miklós TI - Despite its sequence identity with canonical H4, Drosophila H4r product is enriched at specific chromatin regions JF - SCIENTIFIC REPORTS J2 - SCI REP VL - 12 PY - 2022 IS - 1 PG - 11 SN - 2045-2322 DO - 10.1038/s41598-022-09026-x UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/32741372 ID - 32741372 N1 - Funding Agency and Grant Number: University of SzegedEuropean Commission; National Research, Development and Innovation OfficeNational Research, Development & Innovation Office (NRDIO) - Hungary [OTKA-116372]; Ministry for National Economy of Hungary [GINOP-2.3.2-15-2016-00032]; Hungarian National Research, Development and Innovation OfficeNational Research, Development & Innovation Office (NRDIO) - Hungary [UNKP-19-4-SZTE-118, UNKP-20-5-SZTE-671, UNKP-21-5-SZTE-574]; Janos Bolyai Research Scholarship of the Hungarian Academy of SciencesHungarian Academy of Sciences [BO/902/19, BO/00522/19/8]; National Research, Development and Innovation Office, Young Researchers' Excellence Programme [OTKA-FK: FK132183] Funding text: Open access funding provided by University of Szeged. National Research, Development and Innovation Office [OTKA-116372]; Ministry for National Economy of Hungary [GINOP-2.3.2-15-2016-00032]. Z.V. was supported by Grants UNKP-19-4-SZTE-118 and UNKP-20-5-SZTE-671, L.B. by UNKP-21-5-SZTE-574 from the Hungarian National Research, Development and Innovation Office. Z.V. and L.B. received Janos Bolyai Research Scholarship of the Hungarian Academy of Sciences (BO/902/19 and BO/00522/19/8, respectively) A.Sz. was supported by the National Research, Development and Innovation Office, Young Researchers' Excellence Programme (OTKA-FK: FK132183). Open acces charge provided by institutional basic funding. LA - English DB - MTMT ER - TY - JOUR AU - Henn, László AU - Szabó, Anikó AU - Imre, László AU - Román, Ádám AU - Ábrahám, Andrea AU - Vedelek, Balázs AU - Nánási, Péter Pál AU - Boros, Imre Miklós TI - Alternative linker histone permits fast paced nuclear divisions in early Drosophila embryo JF - NUCLEIC ACIDS RESEARCH J2 - NUCLEIC ACIDS RES VL - 48 PY - 2020 IS - 16 SP - 9007 EP - 9018 PG - 12 SN - 0305-1048 DO - 10.1093/nar/gkaa624 UR - https://m2.mtmt.hu/api/publication/31397830 ID - 31397830 AB - In most animals, the start of embryogenesis requires specific histones. In Drosophila linker histone variant BigH1 is present in early embryos. To uncover the specific role of this alternative linker histone at early embryogenesis, we established fly lines in which domains of BigH1 have been replaced partially or completely with that of H1. Analysis of the resulting Drosophila lines revealed that at normal temperature somatic H1 can substitute the alternative linker histone, but at low temperature the globular and C-terminal domains of BigH1 are essential for embryogenesis. In the presence of BigH1 nucleosome stability increases and core histone incorporation into nucleosomes is more rapid, while nucleosome spacing is unchanged. Chromatin formation in the presence of BigH1 permits the fast-paced nuclear divisions of the early embryo. We propose a model which explains how this specific linker histone ensures the rapid nucleosome reassembly required during quick replication cycles at the start of embryogenesis. LA - English DB - MTMT ER -