Improve-RRBS: a novel tool to correct the 3′ trimming of reduced representation sequencing reads

Fóthi, Ábel [Fóthi, Ábel (genetika), szerző] Molekuláris Biológiai Tanszék (SE / AOK / I / BMBI); Molekuláris Élettudományi Intézet (HRN TTK); Liu, Hongbo; Susztak, Katalin; Aranyi, Tamas ✉ [Arányi, Tamás (Génexpresszió sza...), szerző] Molekuláris Biológiai Tanszék (SE / AOK / I / BMBI); Molekuláris Élettudományi Intézet (HRN TTK)

Angol nyelvű Szakcikk (Folyóiratcikk) Tudományos
Megjelent: Bioinformatics Advances 2635-0041 4 (1) Paper: vbae076 , 8 p. 2024
  • SJR Scopus - Computer Science Applications: Q1
Azonosítók
Támogatások:
  • (TKP2020-NKA-20)
  • (K-132695)
Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS) is a popular approach to determine DNA methylation of the CpG-rich regions of the genome. However, we observed that false positive differentially methylated sites (DMS) are also identified using the standard computational analysis.
Hivatkozás stílusok: IEEEACMAPAChicagoHarvardCSLMásolásNyomtatás
2025-03-29 22:24