DNA methylome, R-loop and clinical exome profiling of patients with sporadic amyotrophic lateral sclerosis

Feró, Orsolya [Feró, Orsolya (ökológia, viselke...), szerző]; Varga, Dóra*; Nagy, Éva; Karányi, Zsolt [Karányi, Zsolt (biostatisztika, b...), szerző] Belgyógyászati Intézet (DE / ÁOK); Sipos, Éva [Sipos, Éva (gyógyszerész), szerző] Biofarmácia Tanszék (DE / GYTK); Engelhardt, József [Engelhardt, József István (Neurológia), szerző] Neurológiai Klinika (SZTE / SZAOK); Török, Nóra [Török, Nóra (neurobiológia, ge...), szerző] Neurológiai Klinika (SZTE / SZAOK); Balogh, István [Balogh, István (Klinikai laborató...), szerző] Klinikai Genetikai Tanszék (DE / ÁOK / LMI); Vető, Borbála [Vető, Borbála (biológiai tudományok), szerző]; Likó, István; Fóthi, Ábel [Fóthi, Ábel (genetika), szerző] Enzimológiai Intézet (TTK); Szabó, Zoltán [Szabó, Zoltán (kardiológia, belg...), szerző] Sürgősségi Orvostani Tanszék (DE / ÁOK); Halmos, Gábor [Halmos, Gábor (Experimentális on...), szerző] Biofarmácia Tanszék (DE / GYTK); Vécsei, László [Vécsei, László (Neurológia), szerző] Neurológiai Klinika (SZTE / SZAOK); Arányi, Tamás ✉ [Arányi, Tamás (Génexpresszió sza...), szerző] Enzimológiai Intézet (TTK); Molekuláris Biológiai Tanszék (SE / AOK / I / BMBI); Székvölgyi, Lóránt ✉ [Székvölgyi, Lóránt (Kromatin szerkezet), szerző] Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet (DE / ÁOK); MTA-DE Lendület Genom Szerkezet és Rekombináció... (DE / ÁOK); Gyógyszertechnológiai Tanszék (DE / GYTK)

Angol nyelvű Szakcikk (Folyóiratcikk) Tudományos
Megjelent: SCIENTIFIC DATA 2052-4463 11 (1) Paper: 123 , 12 p. 2024
  • Regionális Tudományok Bizottsága: B nemzetközi
  • SJR Scopus - Computer Science Applications: D1
Azonosítók
Támogatások:
  • (K-142137)
  • (NKFIH-NNE-130913)
  • (K-132695)
  • (TKP2021-EGA-18) Támogató: NKFIH
  • (TKP2021-EGA-20)
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a fatal neurodegenerative disorder characterized by the death of motor neurons, the aetiology of which is essentially unknown. Here, we present an integrative epigenomic study in blood samples from seven clinically characterised sporadic ALS patients to elucidate molecular factors associated with the disease. We used clinical exome sequencing (CES) to study DNA variants, DNA-RNA hybrid immunoprecipitation sequencing (DRIP-seq) to assess R-loop distribution, and reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) to examine DNA methylation changes. The above datasets were combined to create a comprehensive repository of genetic and epigenetic changes associated with the ALS cases studied. This repository is well-suited to unveil new correlations within individual patients and across the entire patient cohort. The molecular attributes described here are expected to guide further mechanistic studies on ALS, shedding light on the underlying genetic causes and facilitating the development of new epigenetic therapies to combat this life-threatening disease.
Hivatkozás stílusok: IEEEACMAPAChicagoHarvardCSLMásolásNyomtatás
2026-09-05 23:03