The artificial intelligence-based model ANORAK improves histopathological grading of lung adenocarcinoma.

Pan, Xiaoxi; AbdulJabbar, Khalid; Coelho-Lima, Jose; Grapa, Anca-Ioana; Zhang, Hanyun; Cheung, Alvin Ho Kwan; Baena, Juvenal; Karasaki, Takahiro; Wilson, Claire Rachel; Sereno, Marco; Veeriah, Selvaraju; Aitken, Sarah J; Hackshaw, Allan; Nicholson, Andrew G; Jamal-Hanjani, Mariam; Swanton, Charles; TRACERx Consortium [Kollaborációs szervezet]; Yuan, Yinyin** ✉; Le Quesne, John** ✉; Moore, David A** ✉; Le Quesne, John [Kollaborációs közreműködő]; Janes, Sam M [Kollaborációs közreműködő]; Hacker, Anne-Marie [Kollaborációs közreműködő]; Sharp, Abigail [Kollaborációs közreműködő]; Smith, Sean [Kollaborációs közreműködő]; Dhanda, Harjot Kaur [Kollaborációs közreműködő]; Chan, Kitty [Kollaborációs közreműködő]; Pilotti, Camilla [Kollaborációs közreműködő]; Leslie, Rachel [Kollaborációs közreműködő]; Chuter, David [Kollaborációs közreműködő]; MacKenzie, Mairead [Kollaborációs közreműködő]; Chee, Serena [Kollaborációs közreműködő]; Alzetani, Aiman [Kollaborációs közreműködő]; Lim, Eric [Kollaborációs közreműködő]; De Sousa, Paulo [Kollaborációs közreműködő]; Jordan, Simon [Kollaborációs közreműködő]; Rice, Alexandra [Kollaborációs közreműködő]; Raubenheimer, Hilgardt [Kollaborációs közreműködő]; Bhayani, Harshil [Kollaborációs közreműködő]; Ambrose, Lyn [Kollaborációs közreműködő]; Devaraj, Anand [Kollaborációs közreműködő]; Chavan, Hema [Kollaborációs közreműködő]; Begum, Sofina [Kollaborációs közreműködő]; Buderi, Silviu I [Kollaborációs közreműködő]; Kaniu, Daniel [Kollaborációs közreműködő]; Malima, Mpho [Kollaborációs közreműködő]; Booth, Sarah [Kollaborációs közreműködő]; Fernandes, Nadia [Kollaborációs közreműködő]; Shah, Pratibha [Kollaborációs közreműködő]; Proli, Chiara [Kollaborációs közreműködő]; Hewish, Madeleine [Kollaborációs közreműködő]; Danson, Sarah [Kollaborációs közreműködő]; Shackcloth, Michael J [Kollaborációs közreműködő]; Robinson, Lily [Kollaborációs közreműködő]; Russell, Peter [Kollaborációs közreműködő]; Blyth, Kevin G [Kollaborációs közreműködő]; Kidd, Andrew [Kollaborációs közreműködő]; Kirk, Alan [Kollaborációs közreműködő]; Asif, Mo [Kollaborációs közreműködő]; Bilancia, Rocco [Kollaborációs közreműködő]; Kostoulas, Nikos [Kollaborációs közreműködő]; Thomas, Mathew [Kollaborációs közreműködő]; Dick, Craig [Kollaborációs közreműködő]; Lester, Jason F [Kollaborációs közreműködő]; Bajaj, Amrita [Kollaborációs közreműködő]; Nakas, Apostolos [Kollaborációs közreműködő]; Sodha-Ramdeen, Azmina [Kollaborációs közreműködő]; Tufail, Mohamad [Kollaborációs közreműködő]; Scotland, Molly [Kollaborációs közreműködő]; Boyles, Rebecca [Kollaborációs közreműködő]; Rathinam, Sridhar [Kollaborációs közreműködő]; Fennell, Dean A [Kollaborációs közreműködő]; Wilson, Claire [Kollaborációs közreműködő]; Marrone, Domenic [Kollaborációs közreműködő]; Dulloo, Sean [Kollaborációs közreműködő]; Matharu, Gurdeep [Kollaborációs közreműködő]; Shaw, Jacqui A [Kollaborációs közreműködő]; Riley, Joan [Kollaborációs közreműködő]; Primrose, Lindsay [Kollaborációs közreműködő]; Boleti, Ekaterini [Kollaborációs közreműködő]; Cheyne, Heather [Kollaborációs közreműködő]; Khalil, Mohammed [Kollaborációs közreműködő]; Richardson, Shirley [Kollaborációs közreműködő]; Cruickshank, Tracey [Kollaborációs közreműködő]; Price, Gillian [Kollaborációs közreműködő]; Kerr, Keith M [Kollaborációs közreműködő]; Benafif, Sarah [Kollaborációs közreműködő]; Papadatos-Pastos, Dionysis [Kollaborációs közreműködő]; Wilson, James [Kollaborációs közreműködő]; Ahmad, Tanya [Kollaborációs közreműködő]; French, Jack [Kollaborációs közreműködő]; Gilbert, Kayleigh [Kollaborációs közreműködő]; Naidu, Babu [Kollaborációs közreműködő]; Patel, Akshay J [Kollaborációs közreműködő]; Osman, Aya [Kollaborációs közreműködő]; Lacson, Christer [Kollaborációs közreműködő]; Langman, Gerald [Kollaborációs közreműködő]; Shackleford, Helen [Kollaborációs közreműködő]; Djearaman, Madava [Kollaborációs közreműködő]; Kadiri, Salma [Kollaborációs közreműködő]; Middleton, Gary [Kollaborációs közreműködő]; Leek, Angela [Kollaborációs közreműködő]; Hodgkinson, Jack Davies [Kollaborációs közreműködő]; Totten, Nicola [Kollaborációs közreműködő]; Montero, Angeles [Kollaborációs közreműködő]; Smith, Elaine [Kollaborációs közreműködő]; Fontaine, Eustace [Kollaborációs közreműködő]; Granato, Felice [Kollaborációs közreműködő]; Novasio, Juliette [Kollaborációs közreműködő]; Rammohan, Kendadai [Kollaborációs közreműködő]; Joseph, Leena [Kollaborációs közreműködő]; Bishop, Paul [Kollaborációs közreműködő]; Shah, Rajesh [Kollaborációs közreműködő]; Moss, Stuart [Kollaborációs közreműködő]; Joshi, Vijay [Kollaborációs közreműködő]; Crosbie, Philip [Kollaborációs közreműködő]; Paiva-Correia, Antonio [Kollaborációs közreműködő]; Chaturvedi, Anshuman [Kollaborációs közreműködő]; Priest, Lynsey [Kollaborációs közreműködő]; Oliveira, Pedro [Kollaborációs közreműködő]; Gomes, Fabio [Kollaborációs közreműködő]; Brown, Kate [Kollaborációs közreműködő]; Carter, Mathew [Kollaborációs közreműködő]; Lindsay, Colin R [Kollaborációs közreműködő]; Blackhall, Fiona H [Kollaborációs közreműködő]; Krebs, Matthew G [Kollaborációs közreműködő]; Summers, Yvonne [Kollaborációs közreműködő]; Clipson, Alexandra [Kollaborációs közreműködő]; Tugwood, Jonathan [Kollaborációs közreműködő]; Kerr, Alastair [Kollaborációs közreműködő]; Rothwell, Dominic G [Kollaborációs közreműködő]; Dive, Caroline [Kollaborációs közreműködő]; Aerts, Hugo J W L [Kollaborációs közreműködő]; Schwarz, Roland F [Kollaborációs közreműködő]; Kaufmann, Tom L [Kollaborációs közreműködő]; Van Loo, Peter [Kollaborációs közreműködő]; Wilson, Gareth A [Kollaborációs közreműködő]; Rosenthal, Rachel [Kollaborációs közreműködő]; Rowan, Andrew [Kollaborációs közreműködő]; Bailey, Chris [Kollaborációs közreműködő]; Lee, Claudia [Kollaborációs közreműködő]; Colliver, Emma [Kollaborációs közreműködő]; Enfield, Katey S S [Kollaborációs közreműködő]; Hill, Mark S [Kollaborációs közreműködő]; Angelova, Mihaela [Kollaborációs közreműködő]; Pich, Oriol [Kollaborációs közreműködő]; Leung, Michelle [Kollaborációs közreműködő]; Frankell, Alexander M [Kollaborációs közreműködő]; Hiley, Crispin T [Kollaborációs közreműködő]; Lim, Emilia L [Kollaborációs közreműködő]; Zhai, Haoran [Kollaborációs közreműködő]; Bakir, Maise Al [Kollaborációs közreműködő]; Birkbak, Nicolai J [Kollaborációs közreműködő]; Lucas, Olivia [Kollaborációs közreműködő]; Huebner, Ariana [Kollaborációs közreműködő]; Puttick, Clare [Kollaborációs közreműködő]; Grigoriadis, Kristiana [Kollaborációs közreműködő]; Dietzen, Michelle [Kollaborációs közreműködő]; Biswas, Dhruva [Kollaborációs közreműködő]; Athanasopoulou, Foteini [Kollaborációs közreműködő]; Ward, Sophia [Kollaborációs közreműködő]; Demeulemeester, Jonas [Kollaborációs közreműködő]; Castignani, Carla [Kollaborációs közreműködő]; Cadieux, Elizabeth Larose [Kollaborációs közreműködő]; Kisistok, Judit [Kollaborációs közreműködő]; Sokac, Mateo [Kollaborációs közreműködő]; Szallasi, Zoltan [Szállási, Zoltán (Onkológia, dagana...), Kollaborációs közreműködő] Bioinformatika Tanszék (SE / AOK / I); Diossy, Miklos [Kollaborációs közreműködő]; Salgado, Roberto [Kollaborációs közreműködő]; Stewart, Aengus [Kollaborációs közreműködő]; Magness, Alastair [Kollaborációs közreműködő]; Weeden, Clare E [Kollaborációs közreműködő]; Levi, Dina [Kollaborációs közreműködő]; Grönroos, Eva [Kollaborációs közreműködő]; Noorani, Imran [Kollaborációs közreműködő]; Goldman, Jacki [Kollaborációs közreműködő]; Escudero, Mickael [Kollaborációs közreműködő]; Hobson, Philip [Kollaborációs közreműködő]; Vendramin, Roberto [Kollaborációs közreműködő]; Boeing, Stefan [Kollaborációs közreműködő]; Denner, Tamara [Kollaborációs közreműködő]; Barbè, Vittorio [Kollaborációs közreműködő]; Lu, Wei-Ting [Kollaborációs közreműködő]; Hill, William [Kollaborációs közreműködő]; Naito, Yutaka [Kollaborációs közreműködő]; Ramsden, Zoe [Kollaborációs közreműködő]; Kassiotis, George [Kollaborációs közreműködő]; Dwornik, Angela [Kollaborációs közreműködő]; Karamani, Angeliki [Kollaborációs közreműködő]; Chain, Benny [Kollaborációs közreműködő]; Pearce, David R [Kollaborációs közreműködő]; Karagianni, Despoina [Kollaborációs közreműködő]; Gálvez-Cancino, Felip [Kollaborációs közreműködő]; Stavrou, Georgia [Kollaborációs közreműködő]; Mastrokalos, Gerasimos [Kollaborációs közreműködő]; Lowe, Helen L [Kollaborációs közreműködő]; Matos, Ignacio Garcia [Kollaborációs közreműködő]; Reading, James L [Kollaborációs közreműködő]; Hartley, John A [Kollaborációs közreműködő]; Selvaraju, Kayalvizhi [Kollaborációs közreműködő]; Chen, Kezhong [Kollaborációs közreműködő]; Ensell, Leah [Kollaborációs közreműködő]; Shah, Mansi [Kollaborációs közreműködő]; Litovchenko, Maria [Kollaborációs közreműködő]; Chervova, Olga [Kollaborációs közreműködő]; Pawlik, Piotr [Kollaborációs közreműködő]; Hynds, Robert E [Kollaborációs közreműködő]; Gamble, Samuel [Kollaborációs közreműködő]; Ung, Seng Kuong Anakin [Kollaborációs közreműködő]; Bola, Supreet Kaur [Kollaborációs közreműködő]; Spanswick, Victoria [Kollaborációs közreműködő]; Wu, Yin [Kollaborációs közreműködő]; Al-Sawaf, Othman [Kollaborációs közreműködő]; Jones, Thomas Patrick [Kollaborációs közreműködő]; Beck, Stephan [Kollaborációs közreműködő]; Tanic, Miljana [Kollaborációs közreműködő]; Marafioti, Teresa [Kollaborációs közreműködő]; Borg, Elaine [Kollaborációs közreműködő]; Falzon, Mary [Kollaborációs közreműködő]; Khiroya, Reena [Kollaborációs közreműködő]; Toncheva, Antonia [Kollaborációs közreműködő]; Abbosh, Christopher [Kollaborációs közreműködő]; Richard, Corentin [Kollaborációs közreműködő]; Naceur-Lombardelli, Cristina [Kollaborációs közreműködő]; Gimeno-Valiente, Francisco [Kollaborációs közreműködő]; Thakkar, Krupa [Kollaborációs közreműködő]; Sunderland, Mariana Werner [Kollaborációs közreműködő]; Sivakumar, Monica [Kollaborációs közreműködő]; Kanu, Nnennaya [Kollaborációs közreműködő]; Prymas, Paulina [Kollaborációs közreműködő]; Saghafinia, Sadegh [Kollaborációs közreműködő]; Vanloo, Sharon [Kollaborációs közreműködő]; Lam, Jie Min [Kollaborációs közreműködő]; Liu, Wing Kin [Kollaborációs közreműködő]; Bunkum, Abigail [Kollaborációs közreműködő]; Hessey, Sonya [Kollaborációs közreműködő]; Zaccaria, Simone [Kollaborációs közreműködő]; Martínez-Ruiz, Carlos [Kollaborációs közreműködő]; Black, James R M [Kollaborációs közreműködő]; Thol, Kerstin [Kollaborációs közreműködő]; Bentham, Robert [Kollaborációs közreműködő]; Litchfield, Kevin [Kollaborációs közreműködő]; McGranahan, Nicholas [Kollaborációs közreműködő]; Quezada, Sergio A [Kollaborációs közreműködő]; Forster, Martin D [Kollaborációs közreműködő]; Lee, Siow Ming [Kollaborációs közreműködő]; Herrero, Javier [Kollaborációs közreműködő]; Nye, Emma [Kollaborációs közreműködő]; Stone, Richard Kevin [Kollaborációs közreműködő]; Nicod, Jerome [Kollaborációs közreműködő]; Rane, Jayant K [Kollaborációs közreműködő]; Peggs, Karl S [Kollaborációs közreműködő]; Ng, Kevin W [Kollaborációs közreműködő]; Dijkstra, Krijn [Kollaborációs közreműködő]; Huska, Matthew R [Kollaborációs közreműködő]; Hoogenboom, Emilie Martinoni [Kollaborációs közreműködő]; Monk, Fleur [Kollaborációs közreműködő]; Holding, James W [Kollaborációs közreműködő]; Choudhary, Junaid [Kollaborációs közreműködő]; Bhakhri, Kunal [Kollaborációs közreműködő]; Scarci, Marco [Kollaborációs közreműködő]; Gorman, Pat [Kollaborációs közreműködő]; Stephens, Robert C M [Kollaborációs közreműködő]; Wong, Yien Ning Sophia [Kollaborációs közreműködő]; Kaplar, Zoltan [Kollaborációs közreműködő]; Bandula, Steve [Kollaborációs közreműködő]; Watkins, Thomas B K [Kollaborációs közreműködő]; Veiga, Catarina [Kollaborációs közreműködő]; Royle, Gary [Kollaborációs közreműködő]; Collins-Fekete, Charles-Antoine [Kollaborációs közreműködő]; Fraioli, Francesco [Kollaborációs közreműködő]; Ashford, Paul [Kollaborációs közreműködő]; Procter, Alexander James [Kollaborációs közreműködő]; Ahmed, Asia [Kollaborációs közreműködő]; Taylor, Magali N [Kollaborációs közreműködő]; Nair, Arjun [Kollaborációs közreműködő]; Lawrence, David [Kollaborációs közreműködő]; Patrini, Davide [Kollaborációs közreműködő]; Navani, Neal [Kollaborációs közreműködő]; Thakrar, Ricky M [Kollaborációs közreműködő]

Angol nyelvű Sokszerzős vagy csoportos szerzőségű szakcikk (Folyóiratcikk) Tudományos
Megjelent: NATURE CANCER 2662-1347 5 (2) pp. 347-363 2024
  • SJR Scopus - Cancer Research: D1
Azonosítók
Szakterületek:
  • Klinikai orvostan
The introduction of the International Association for the Study of Lung Cancer grading system has furthered interest in histopathological grading for risk stratification in lung adenocarcinoma. Complex morphology and high intratumoral heterogeneity present challenges to pathologists, prompting the development of artificial intelligence (AI) methods. Here we developed ANORAK (pyrAmid pooliNg crOss stReam Attention networK), encoding multiresolution inputs with an attention mechanism, to delineate growth patterns from hematoxylin and eosin-stained slides. In 1,372 lung adenocarcinomas across four independent cohorts, AI-based grading was prognostic of disease-free survival, and further assisted pathologists by consistently improving prognostication in stage I tumors. Tumors with discrepant patterns between AI and pathologists had notably higher intratumoral heterogeneity. Furthermore, ANORAK facilitates the morphological and spatial assessment of the acinar pattern, capturing acinus variations with pattern transition. Collectively, our AI method enabled the precision quantification and morphology investigation of growth patterns, reflecting intratumoral histological transitions in lung adenocarcinoma.
Hivatkozás stílusok: IEEEACMAPAChicagoHarvardCSLMásolásNyomtatás
2025-03-30 06:13