https://m2.mtmt.hu/ hun 2026-05-01 04:54 JournalArticle 34059784 VALIDATED true 0 false 2026-04-11T20:01:09.189+0000 2026-01-29T22:36:36.882+0000 2023-07-12T11:49:05.566+0000 true 10083204 Herold Zoltán /api/admin/10083204 Admin Herold Zoltán (SE_AOK_SE_1Bel_Onkol_Admin5_HZ, admin) true 2026-04-11T20:00:06.606+0000 2026-01-29T22:36:37.106+0000 true 10063514 Mikola Katalin /api/admin/10063514 Admin Mikola Katalin (MTMT 3, admin) true 10063514 Admin 10063514 /api/admin/10063514 Mikola Katalin (MTMT 3, admin) Mikola Katalin true 10063514 true 2026-01-21T13:12:53.998+0000 true false true 24 24 /api/publicationtype/24 PublicationType Folyóiratcikk 1 true 24 JournalArticle true 10000059 Article true 24 24 /api/publicationtype/24 PublicationType Folyóiratcikk 1 true 24 JournalArticle /api/subtype/10000059 Szakcikk SubType Szakcikk (Folyóiratcikk) 101 true 10000059 true 1 /api/category/1 Category Tudományos true 1 Szeitz, Beáta true true /api/journal/10003252 REVIEWED INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 1661-6596 1422-0067 true false 10003252 false 10003252 true 1661-6596 1422-0067 Journal FOREIGN 24 14 11369 11369 21 2023 Pulmonary adenocarcinomas (pADCs) with an ALK rearrangement are a rare cancer subtype, necessitating comprehensive molecular investigations to unravel their heterogeneity and improve therapeutic strategies. In this pilot study, we employed spatial transcriptomic (NanoString GeoMx) and proteomic profiling to investigate seven treatment-naïve pADCs with an ALK rearrangement. On each FFPE tumor slide, 12 smaller and 2–6 larger histopathologically annotated regions were selected for transcriptomic and proteomic analysis, respectively. The correlation between proteomics and transcriptomics was modest (average Pearson’s r = 0.43 at the gene level). Intertumoral heterogeneity was more pronounced than intratumoral heterogeneity, and normal adjacent tissue exhibited distinct molecular characteristics. We identified potential markers and dysregulated pathways associated with tumors, with a varying extent of immune infiltration, as well as with mucin and stroma content. Notably, some markers appeared to be specific to the ALK-driven subset of pADCs. Our data showed that within tumors, elements of the extracellular matrix, including FN1, exhibited substantial variability. Additionally, we mapped the co-localization patterns of tumor microenvironment elements. This study represents the first spatially resolved profiling of ALK-driven pADCs at both the gene and protein expression levels. Our findings may contribute to a better understanding of this cancer type prior to treatment with ALK inhibitors. Funding 2030091 /api/funding/2030091 (KNN121510) false true Funding 2030092 /api/funding/2030092 Az orvos-, egészségtudományi- és gyógyszerészképzés tudományos műhelyeinek fejlesztése(EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009) Támogató: EFOP-VEKOP false true Funding 2030093 /api/funding/2030093 (ÚNKP-22–3-II) false true Funding 2030094 /api/funding/2030094 János Bolyai Research Scholarship of the Hungarian Academy of Sciences false true Funding 2030095 /api/funding/2030095 (FK131603) false true Funding 2030096 /api/funding/2030096 (K129065) false true Funding 2030097 /api/funding/2030097 (The APC was funded by Semmelweis University) false true true true 2023 true true true false true false GOLD 2026-04-11 true https://doi.org/10.3390/ijms241411369 4 0 4 4 0 4 4 3 4 4 4 4 4 4 0 0 4 4 4 4 0 5 5 Folyóiratcikk Journal Article 24 4 Könyvrészlet Chapter in Book 25 0 Könyv Book 23 0 Egyéb konferenciaközlemény Conference paper 31 0 Egyéb konferenciakötet Conference proceedings 32 0 Oltalmi formák Protection forms 26 0 Disszertáció Thesis 28 0 Egyéb Miscellaneous 29 0 Alkotás Achievement 22 0 Kutatási adat Research data 33 0 Folyóiratcikk Journal Article 24 0 0 0 Könyvrészlet Chapter in Book 25 0 0 0 Könyv Book 23 0 0 0 Egyéb konferenciaközlemény Conference paper 31 0 0 0 Egyéb konferenciakötet Conference proceedings 32 0 0 0 Oltalmi formák Protection forms 26 0 0 0 Disszertáció Thesis 28 0 0 0 Egyéb Miscellaneous 29 0 0 0 Alkotás Achievement 22 0 0 0 Kutatási adat Research data 33 0 0 0 2024 0 2 2 2 2 2025 0 2 2 2 2 D1 false 10023803 false false false 2023-07-11T11:49:16.642+0000 Belgyógyászati és Onkológiai Klinika (SE / AOK / K); Bioinformatika Tanszék (SE / AOK / I); Doktori Iskola (SE); MS Proteomika Kutatócsoport (HRN TTK / SZKI); Patológiai, Igazságügyi és Biztosítási Orvostan... (SE / AOK / I); Szerves Kémiai Intézet (MTA TTK); Tumorbiológiai Osztály (OKPI) 9 46 7 12 0 true 10063514 Language 10002 /api/language/10002 Angol Angol English true 2 true PersonAuthorship 109260173 /api/authorship/109260173 Szeitz, Beáta [Szeitz, Beáta (Patológia), szerző] Belgyógyászati és Onkológiai Klinika (SE / AOK / K) 1 0.083333336 true false Author 10074938 /api/author/10074938 Szeitz Beáta (Patológia) Szeitz Beáta true true Szeitz Beáta true false false AuthorshipType 1 /api/authorshiptype/1 Szerző 0 true 0 true false true PersonAuthorship 109260174 /api/authorship/109260174 Glasz, Tibor [Glasz, Tibor (patologia), szerző] Patológiai, Igazságügyi és Biztosítási Orvostan... (SE / AOK / I) 2 0.083333336 false false Author 10023815 /api/author/10023815 Glasz Tibor (patologia) Glasz Tibor true 10023815 true Glasz Tibor true false false AuthorshipType 1 /api/authorshiptype/1 Szerző 0 true 0 true false true PersonAuthorship 109260175 /api/authorship/109260175 Herold, Zoltán [Herold, Zoltán (Onkológia, Biosta...), szerző] Belgyógyászati és Onkológiai Klinika (SE / AOK / K) 3 0.083333336 false false Author 10048640 /api/author/10048640 Herold Zoltán (Onkológia, Biostatisztika, Diabetológia) Herold Zoltán true 10048640 true Herold Zoltán true false false AuthorshipType 1 /api/authorshiptype/1 Szerző 0 true 0 true false true PersonAuthorship 109260176 /api/authorship/109260176 Tóth, Gábor 4 0.083333336 false false Tóth Gábor true false false AuthorshipType 1 /api/authorshiptype/1 Szerző 0 true 0 true false true PersonAuthorship 109260177 /api/authorship/109260177 Balbisi, Mirjam [Balbisi, Mirjam (Kémia), szerző] MS Proteomika Kutatócsoport (HRN TTK / SZKI); Doktori Iskola (SE) 5 0.083333336 false false Author 10081651 /api/author/10081651 Balbisi Mirjam (Kémia) Balbisi Mirjam true true Balbisi Mirjam true false false AuthorshipType 1 /api/authorshiptype/1 Szerző 0 true 0 true false true PersonAuthorship 109260178 /api/authorship/109260178 Fillinger, János [Fillinger, János (patológia), szerző] 6 0.083333336 false false Author 10023823 /api/author/10023823 Fillinger János (patológia) Fillinger János true 10023823 true Fillinger János true false false AuthorshipType 1 /api/authorshiptype/1 Szerző 0 true 0 true false true PersonAuthorship 109260179 /api/authorship/109260179 Horváth, Szabolcs 7 0.083333336 false false Horváth Szabolcs true false false AuthorshipType 1 /api/authorshiptype/1 Szerző 0 true 0 true false true PersonAuthorship 109260180 /api/authorship/109260180 Mohácsi, Réka [Mohácsi, Réka (digitális patológia), szerző] Belgyógyászati és Onkológiai Klinika (SE / AOK / K) 8 0.083333336 false false Author 10061730 /api/author/10061730 Mohácsi Réka (digitális patológia) Mohácsi Réka true 10061730 true Mohácsi Réka true false false AuthorshipType 1 /api/authorshiptype/1 Szerző 0 true 0 true false true PersonAuthorship 109260181 /api/authorship/109260181 Jeong Kwon, Ho 9 0.083333336 false false Jeong Kwon Ho true false false AuthorshipType 1 /api/authorshiptype/1 Szerző 0 true 0 true false true PersonAuthorship 109260182 /api/authorship/109260182 Moldvay, Judit [Moldvay, Judit (Tüdõgyógyászat), szerző] 10 0.083333336 false false Author 10003072 /api/author/10003072 Moldvay Judit (Tüdõgyógyászat) Moldvay Judit true 10003072 true Moldvay Judit true false false AuthorshipType 1 /api/authorshiptype/1 Szerző 0 true 0 true false true PersonAuthorship 109260183 /api/authorship/109260183 Turiák, Lilla [Turiák, Lilla (tömegspektrometri...), szerző] Szerves Kémiai Intézet (MTA TTK); Doktori Iskola (SE) 11 0.083333336 false false Author 10024570 /api/author/10024570 Turiák Lilla (tömegspektrometria, proteomika) Turiák Lilla true 10024570 true Turiák Lilla true false false AuthorshipType 1 /api/authorshiptype/1 Szerző 0 true 0 true false true PersonAuthorship 109260184 /api/authorship/109260184 Szász, Attila Marcell ✉ [Szász, Attila Marcell (emlőpatologia), szerző] Bioinformatika Tanszék (SE / AOK / I); Belgyógyászati és Onkológiai Klinika (SE / AOK / K); Tumorbiológiai Osztály (OKPI) 12 0.083 false true true Author 10023803 /api/author/10023803 Szász Attila Marcell (emlőpatologia) Szász Attila Marcell true 10023803 true Szász Attila Marcell true false false AuthorshipType 1 /api/authorshiptype/1 Szerző 0 true 0 true false true PublicationIdentifier 24153654 /api/publicationidentifier/24153654 DOI: 10.3390/ijms241411369 PlainSource 6 /api/publicationsource/6 DOI PublicationSourceType 10001 /api/publicationsourcetype/10001 DOI true true true DOI DOI https://doi.org/@@@ true true 6 true GOLD true IDENTICAL 10.3390/ijms241411369 https://doi.org/10.3390/ijms241411369 false true PublicationIdentifier 24285616 /api/publicationidentifier/24285616 WoS: 001038755000001 PlainSource 1 /api/publicationsource/1 WoS PublicationSourceType 10003 /api/publicationsourcetype/10003 Indexelő adatbázis false true true WoS WoS https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/@@@ true true 1 true IDENTICAL 001038755000001 https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/001038755000001 true true PublicationIdentifier 24285617 /api/publicationidentifier/24285617 Scopus: 85166253533 PlainSource 3 /api/publicationsource/3 Scopus PublicationSourceType 10003 /api/publicationsourcetype/10003 Indexelő adatbázis false true true Scopus Scopus http://www.scopus.com/record/display.url?origin=inward&eid=2-s2.0-@@@ true true 3 true IDENTICAL 85166253533 http://www.scopus.com/record/display.url?origin=inward&eid=2-s2.0-85166253533 true true PublicationIdentifier 24223587 /api/publicationidentifier/24223587 PubMed: 37511126 PlainSource 17 /api/publicationsource/17 PubMed PublicationSourceType 10003 /api/publicationsourcetype/10003 Indexelő adatbázis false true true PubMed PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&list_uids=@@@&dopt=Abstract true true 17 true IDENTICAL 37511126 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&list_uids=37511126&dopt=Abstract false true PublicationIdentifier 24223588 /api/publicationidentifier/24223588 Pubmed Central: PMC10380216 PlainSource 137 /api/publicationsource/137 Pubmed Central PublicationSourceType 10007 /api/publicationsourcetype/10007 Repozitórium true true true Pubmed Central http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/@@@ true true 137 true NONE true IDENTICAL PMC10380216 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10380216 false true Classification 12215 /api/classification/12215 Klinikai orvostan true true Classification 12306 /api/classification/12306 Onkológia true true Classification 12530 /api/classification/12530 Orvosi biotechnológia true true SjrRating 11388415 /api/sjrrating/11388415 sjr:D1 (2023) Scopus - Inorganic Chemistry INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 1661-6596 1422-0067 7 0.1 journal RatingType 10002 /api/ratingtype/10002 sjr sjr true true ClassificationExternal 1604 /api/classificationexternal/1604 Scopus - Inorganic Chemistry true 1604 true D1 DIRECT true true /api/publication/34059784 Szeitz Beáta et al. Spatially Resolved Proteomic and Transcriptomic Profiling of Anaplastic Lymphoma Kinase-Rearranged Pulmonary Adenocarcinomas Reveals Key Players in Inter- and Intratumoral Heterogeneity. (2023) INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 1661-6596 1422-0067 24 14<div class="JournalArticle Publication long-list"> <div class="authors"> <img title="Forrásközlemény" style="float: left" src="/frontend/resources/grid/publication-core-icon.png"> <img title="Idézőközlemény" style="float: left" src="/frontend/resources/grid/publication-citation-icon.png"> <div class="autype autype0"> <span class="author-name" mtid="10074938"><a href="/gui2/?type=authors&mode=browse&sel=10074938" target="_blank">Szeitz Beáta (<span class="authorship-author-name">Szeitz Beáta</span> <span class="authorAux-mtmt"> Patológia</span>) </a> </span> <span class="author-affil"><span title="Semmelweis Egyetem">SE</span>/<span title="Általános Orvostudományi Kar">AOK</span>/<span title="Klinikum">K</span>/Belgyógyászati és Onkológiai Klinika</span> ;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span class="author-name" mtid="10023815"><a href="/gui2/?type=authors&mode=browse&sel=10023815" target="_blank">Glasz Tibor (<span class="authorship-author-name">Glasz Tibor</span> <span class="authorAux-mtmt"> patologia</span>) </a> </span> <span class="author-affil"><span title="Semmelweis Egyetem">SE</span>/<span title="Általános Orvostudományi Kar">AOK</span>/<span title="Intézet">I</span>/Patológiai, Igazságügyi és Biztosítási Orvostani Intézet</span> ;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span class="author-name" mtid="10048640"><a href="/gui2/?type=authors&mode=browse&sel=10048640" target="_blank">Herold Zoltán (<span class="authorship-author-name">Herold Zoltán</span> <span class="authorAux-mtmt"> Onkológia, Biostatisztika, Diabetológia</span>) </a> </span> <span class="author-affil"><span title="Semmelweis Egyetem">SE</span>/<span title="Általános Orvostudományi Kar">AOK</span>/<span title="Klinikum">K</span>/Belgyógyászati és Onkológiai Klinika</span> ;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span class="author-name" >Tóth Gábor </span> ;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span class="author-name" mtid="10081651"><a href="/gui2/?type=authors&mode=browse&sel=10081651" target="_blank">Balbisi Mirjam (<span class="authorship-author-name">Balbisi Mirjam</span> <span class="authorAux-mtmt"> Kémia</span>) </a> </span> <span class="author-affil"><span title="Természettudományi Kutatóközpont">TTK</span>/<span title="Szerves Kémiai Intézet">SZKI</span>/MS Proteomika Kutatócsoport; <span title="Semmelweis Egyetem">SE</span>/Doktori Iskola</span> ;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span class="author-name" mtid="10023823"><a href="/gui2/?type=authors&mode=browse&sel=10023823" target="_blank">Fillinger János (<span class="authorship-author-name">Fillinger János</span> <span class="authorAux-mtmt"> patológia</span>) </a> </span> ;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span class="author-name" >Horváth Szabolcs </span> ;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span class="author-name" mtid="10061730"><a href="/gui2/?type=authors&mode=browse&sel=10061730" target="_blank">Mohácsi Réka (<span class="authorship-author-name">Mohácsi Réka</span> <span class="authorAux-mtmt"> digitális patológia</span>) </a> </span> <span class="author-affil"><span title="Semmelweis Egyetem">SE</span>/<span title="Általános Orvostudományi Kar">AOK</span>/<span title="Klinikum">K</span>/Belgyógyászati és Onkológiai Klinika</span> ;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span class="author-name" >Jeong Kwon Ho </span> ;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span class="author-name" mtid="10003072"><a href="/gui2/?type=authors&mode=browse&sel=10003072" target="_blank">Moldvay Judit (<span class="authorship-author-name">Moldvay Judit</span> <span class="authorAux-mtmt"> Tüdõgyógyászat</span>) </a> </span> ;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span class="author-name" mtid="10024570"><a href="/gui2/?type=authors&mode=browse&sel=10024570" target="_blank">Turiák Lilla (<span class="authorship-author-name">Turiák Lilla</span> <span class="authorAux-mtmt"> tömegspektrometria, proteomika</span>) </a> </span> <span class="author-affil"><span title="MTA Természettudományi Kutatóközpont">MTA TTK</span>/Szerves Kémiai Intézet; <span title="Semmelweis Egyetem">SE</span>/Doktori Iskola</span> ;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span class="author-name" mtid="10023803"><a href="/gui2/?type=authors&mode=browse&sel=10023803" target="_blank">Szász Attila Marcell ✉ (<span class="authorship-author-name">Szász Attila Marcell</span> <span class="authorAux-mtmt"> emlőpatologia</span>) </a> </span> <span class="author-affil"><span title="Semmelweis Egyetem">SE</span>/<span title="Általános Orvostudományi Kar">AOK</span>/<span title="Intézet">I</span>/Bioinformatika Tanszék; <span title="Semmelweis Egyetem">SE</span>/<span title="Általános Orvostudományi Kar">AOK</span>/<span title="Klinikum">K</span>/Belgyógyászati és Onkológiai Klinika; <span title="Országos Korányi Pulmonológiai Intézet">OKPI</span>/Tumorbiológiai Osztály</span> </div> </div> <div class="title"><a href="/gui2/?mode=browse&params=publication;34059784" target="_blank">Spatially Resolved Proteomic and Transcriptomic Profiling of Anaplastic Lymphoma Kinase-Rearranged Pulmonary Adenocarcinomas Reveals Key Players in Inter- and Intratumoral Heterogeneity</a></div> <div> <span class="journal-title">INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES</span> <span class="journal-issn">(<a target="_blank" href="https://portal.issn.org/resource/ISSN/1661-6596">1661-6596</a> <a target="_blank" href="https://portal.issn.org/resource/ISSN/1422-0067">1422-0067</a>)</span>: <span class="journal-volume">24</span> <span class="journal-issue">14</span> <span class="page"> Paper 11369. 21 p. </span> <span class="year">(2023)</span> </div> <div class="pub-footer"> <span class="language" xmlns="http://www.w3.org/1999/html">Nyelv: Angol | </span> <span class="identifiers"> <span class="id identifier oa_GOLD" title=" Gold "> <a style="color:blue" title="10.3390/ijms241411369" target="_blank" href="https://doi.org/10.3390/ijms241411369"> DOI </a> </span> <span class="id identifier oa_none" title="none"> <a style="color:blue" title="001038755000001" target="_blank" href="https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/001038755000001"> WoS </a> </span> <span class="id identifier oa_none" title="none"> <a style="color:blue" title="85166253533" target="_blank" href="http://www.scopus.com/record/display.url?origin=inward&eid=2-s2.0-85166253533"> Scopus </a> </span> <span class="id identifier oa_none" title="none"> <a style="color:blue" title="37511126" target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&list_uids=37511126&dopt=Abstract"> PubMed </a> </span> <span class="id identifier oa_NONE" title=" Nincs "> <a style="color:blue" title="PMC10380216" target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10380216"> Pubmed Central </a> </span> </span> <OnlyViewableByAuthor><div class="ratings"> <div class="journal-subject">Folyóirat szakterülete: Scopus - Inorganic Chemistry&nbsp;&nbsp;&nbsp;SJR indikátor:&nbsp;D1</div> <div class="journal-subject">Folyóirat szakterülete: Scopus - Organic Chemistry&nbsp;&nbsp;&nbsp;SJR indikátor:&nbsp;D1</div> <div class="journal-subject">Folyóirat szakterülete: Scopus - Spectroscopy&nbsp;&nbsp;&nbsp;SJR indikátor:&nbsp;D1</div> <div class="journal-subject">Folyóirat szakterülete: Scopus - Computer Science Applications&nbsp;&nbsp;&nbsp;SJR indikátor:&nbsp;Q1</div> <div class="journal-subject">Folyóirat szakterülete: Scopus - Medicine (miscellaneous)&nbsp;&nbsp;&nbsp;SJR indikátor:&nbsp;Q1</div> <div class="journal-subject">Folyóirat szakterülete: Scopus - Physical and Theoretical Chemistry&nbsp;&nbsp;&nbsp;SJR indikátor:&nbsp;Q1</div> <div class="journal-subject">Folyóirat szakterülete: Scopus - Catalysis&nbsp;&nbsp;&nbsp;SJR indikátor:&nbsp;Q2</div> <div class="journal-subject">Folyóirat szakterülete: Scopus - Molecular Biology&nbsp;&nbsp;&nbsp;SJR indikátor:&nbsp;Q2</div> </div></OnlyViewableByAuthor> <div class="publication-citation" style="margin-left: 0.5cm;"> <span title="Nyilvános idézőközlemények összesen, említések nélkül" class="citingPub-count">Nyilvános idéző összesen: 4</span> | Független: 4 | Függő: 0 | Nem jelölt: 0 | WoS jelölt: 3 | Scopus jelölt:&nbsp;4 | WoS/Scopus jelölt:&nbsp;4 | DOI jelölt:&nbsp;4 </div> <div class="publication-citation"> <a target="_blank" href="/api/publication?cond=citations.related;eq;34059784&sort=publishedYear,desc&sort=title"> Idézett közlemények száma: 5 </a> </div> <div class="mtid"><span class="long-pub-mtid">Közlemény: 34059784</span> | <span class="status-data status-VALIDATED"> Egyeztetett </span> Forrás Idéző | <span class="type-subtype">Folyóiratcikk ( Szakcikk ) </span> | <span class="pub-category">Tudományos</span> | <span class="publication-sourceOfData">kézi felvitel</span> </div> <div class="funder"> (KNN121510), Az orvos-, egészségtudományi- és gyógyszerészképzés tudományos műhelyeinek fejlesztése(EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009) Támogató: EFOP-VEKOP, (ÚNKP-22–3-II), János Bolyai Research Scholarship of the Hungarian Academy of Sciences, (FK131603), (K129065), (The APC was funded by Semmelweis University) </div> <div class="lastModified">Utolsó módosítás: 2026.01.29. 23:36 Mikola Katalin (MTMT 3, admin) </div> <div class="lockedBy">Központi kezelésű 2026.01.21. 14:12 Mikola Katalin (MTMT 3, admin) </div> </div></div>