Genomic analysis of sewage from 101 countries reveals global landscape of antimicrobial resistance

Munk, Patrick ✉; Brinch, Christian; Møller, Frederik Duus; Petersen, Thomas N.; Hendriksen, Rene S.; Seyfarth, Anne Mette; Kjeldgaard, Jette S.; Svendsen, Christina Aaby; van Bunnik, Bram; Berglund, Fanny; Larsson, D. G. Joakim; Koopmans, Marion; Woolhouse, Mark; Aarestrup, Frank M.; Munk, Patrick [Kollaborációs közreműködő]; Global Sewage Surveillance Consortium [Kollaborációs szervezet]; Brinch, Christian [Kollaborációs közreműködő]; Møller, Frederik Duus [Kollaborációs közreműködő]; Petersen, Thomas N. [Kollaborációs közreműködő]; Hendriksen, Rene S. [Kollaborációs közreműködő]; Seyfarth, Anne Mette [Kollaborációs közreműködő]; Kjeldgaard, Jette S. [Kollaborációs közreműködő]; Svendsen, Christina Aaby [Kollaborációs közreműködő]; van Bunnik, Bram [Kollaborációs közreműködő]; Berglund, Fanny [Kollaborációs közreműködő]; Larsson, D. G. Joakim [Kollaborációs közreműködő]; Koopmans, Marion [Kollaborációs közreműködő]; Woolhouse, Mark [Kollaborációs közreműködő]; Aarestrup, Frank M. [Kollaborációs közreműködő]; Bego, Artan [Kollaborációs közreműködő]; Power, Pablo [Kollaborációs közreműködő]; Rees, Catherine [Kollaborációs közreműködő]; Lambrinidis, Dionisia [Kollaborációs közreműködő]; Neilson, Elizabeth Heather Jakobsen [Kollaborációs közreműködő]; Gibb, Karen [Kollaborációs közreműködő]; Coventry, Kris [Kollaborációs közreműködő]; Collignon, Peter [Kollaborációs közreműködő]; Cassar, Susan [Kollaborációs közreműködő]; Allerberger, Franz [Kollaborációs közreműködő]; Begum, Anowara [Kollaborációs közreműködő]; Hossain, Zenat Zebin [Kollaborációs közreműködő]; Worrell, Carlon [Kollaborációs közreműködő]; Vandenberg, Olivier [Kollaborációs közreműködő]; Pieters, Ilse [Kollaborációs közreműködő]; Victorien, Dougnon Tamègnon [Kollaborációs közreműködő]; Gutierrez, Angela Daniela Salazar [Kollaborációs közreműködő]; Soria, Freddy [Kollaborációs közreműködő]; Grujić, Vesna Rudić [Kollaborációs közreműködő]; Mazalica, Nataša [Kollaborációs közreműködő]; Rahube, Teddie O. [Kollaborációs közreműködő]; Tagliati, Carlos Alberto [Kollaborációs közreműködő]; Rodrigues, Dalia [Kollaborációs közreműködő]; Oliveira, Guilherme [Kollaborációs közreműködő]; de Souza, Larissa Camila Ribeiro [Kollaborációs közreműködő]; Ivanov, Ivan [Kollaborációs közreműködő]; Juste, Bonkoungou Isidore [Kollaborációs közreműködő]; Oumar, Traoré [Kollaborációs közreműködő]; Sopheak, Thet [Kollaborációs közreműködő]; Vuthy, Yith [Kollaborációs közreműködő]; Ngandjio, Antoinette [Kollaborációs közreműködő]; Nzouankeu, Ariane [Kollaborációs közreműködő]; Olivier, Ziem A. Abah Jacques [Kollaborációs közreműködő]; Yost, Christopher K. [Kollaborációs közreműködő]; Kumar, Pratik [Kollaborációs közreműködő]; Brar, Satinder Kaur [Kollaborációs közreműködő]; Tabo, Djim-Adjim [Kollaborációs közreműködő]; Adell, Aiko D. [Kollaborációs közreműködő]; Paredes-Osses, Esteban [Kollaborációs közreműködő]; Martinez, Maria Cristina [Kollaborációs közreműködő]; Cuadros-Orellana, Sara [Kollaborációs közreműködő]; Ke, Changwen [Kollaborációs közreműködő]; Zheng, Huanying [Kollaborációs közreműködő]; Baisheng, Li [Kollaborációs közreműködő]; Lau, Lok Ting [Kollaborációs közreműködő]; Chung, Teresa [Kollaborációs közreműködő]; Jiao, Xiaoyang [Kollaborációs közreműködő]; Yu, Yongjie [Kollaborációs közreműködő]; JiaYong, Zhao [Kollaborációs közreműködő]; Morales, Johan F. Bernal [Kollaborációs közreműködő]; Valencia, Maria Fernanda [Kollaborációs közreműködő]; Donado-Godoy, Pilar [Kollaborációs közreműködő]; Coulibaly, Kalpy Julien [Kollaborációs közreműködő]; Hrenovic, Jasna [Kollaborációs közreműködő]; Jergović, Matijana [Kollaborációs közreműködő]; Karpíšková, Renáta [Kollaborációs közreműködő]; Deogratias, Zozo Nyarukweba [Kollaborációs közreműködő]; Elsborg, Bodil [Kollaborációs közreműködő]; Pernille, Lisbeth Truelstrup Hansen [Kollaborációs közreműködő]; Jensen, Erland [Kollaborációs közreműködő]; Abouelnaga, Mohamed [Kollaborációs közreműködő]; Salem, Mohamed Fathy [Kollaborációs közreműködő]; Koolmeister, Marliin [Kollaborációs közreműködő]; Legesse, Mengistu [Kollaborációs közreműködő]; Eguale, Tadesse [Kollaborációs közreműködő]; Heikinheimo, Annamari [Kollaborációs közreműködő]; Le Guyader, Soizick [Kollaborációs közreműködő]; Schaeffer, Julien [Kollaborációs közreműködő]; Villacis, Jose Eduardo [Kollaborációs közreműködő]; Sanneh, Bakary [Kollaborációs közreműködő]; Malania, Lile [Kollaborációs közreműködő]; Nitsche, Andreas [Kollaborációs közreműködő]; Brinkmann, Annika [Kollaborációs közreműködő]; Schubert, Sara [Kollaborációs közreműködő]; Hesse, Sina [Kollaborációs közreműködő]; Berendonk, Thomas U. [Kollaborációs közreműködő]; Saba, Courage Kosi Setsoafia [Kollaborációs közreműködő]; Mohammed, Jibril [Kollaborációs közreműködő]; Feglo, Patrick Kwame [Kollaborációs közreműködő]; Banu, Regina Ama [Kollaborációs közreműködő]; Kotzamanidis, Charalampos [Kollaborációs közreműködő]; Lytras, Efthymios [Kollaborációs közreműködő]; Lickes, Sergio A. [Kollaborációs közreműködő]; Kocsis, Bela [Kocsis, Béla (mikrobiológia (Se...), Kollaborációs közreműködő] Orvosi Mikrobiológiai Intézet (SE / AOK / I); Solymosi, Norbert [Solymosi, Norbert (bioinformatika, e...), Kollaborációs közreműködő]; Thorsteinsdottir, Thorunn R. [Kollaborációs közreműködő]; Hatha, Abdulla Mohamed [Kollaborációs közreműködő]; Ballal, Mamatha [Kollaborációs közreműködő]; Bangera, Sohan Rodney [Kollaborációs közreműködő]; Fani, Fereshteh [Kollaborációs közreműködő]; Alebouyeh, Masoud [Kollaborációs közreműködő]; Morris, Dearbhaile [Kollaborációs közreműködő]; O’Connor [Kollaborációs közreműködő]; Louise, Cormican Martin [Kollaborációs közreműködő]; Moran-Gilad, Jacob [Kollaborációs közreműködő]; Battisti, Antonio [Kollaborációs közreműködő]; Diaconu, Elena Lavinia [Kollaborációs közreműködő]; Corno, Gianluca [Kollaborációs közreműködő]; Di Cesare, Andrea [Kollaborációs közreműködő]; Alba, Patricia [Kollaborációs közreműködő]; Hisatsune, Junzo [Kollaborációs közreműködő]; Yu, Liansheng [Kollaborációs közreműködő]; Kuroda, Makoto [Kollaborációs közreműködő]; Sugai, Motoyuki [Kollaborációs közreműködő]; Kayama, Shizuo [Kollaborációs közreműködő]; Shakenova, Zeinegul [Kollaborációs közreműködő]; Kiiyukia, Ciira [Kollaborációs közreműködő]; Ng’eno, Eric [Kollaborációs közreműködő]; Raka, Lul [Kollaborációs közreműködő]; Jamil, Kazi [Kollaborációs közreműködő]; Fakhraldeen, Saja Adel [Kollaborációs közreműködő]; Alaati, Tareq [Kollaborációs közreműködő]; Bērziņš, Aivars [Kollaborációs közreműködő]; Avsejenko, Jeļena [Kollaborációs közreműködő]; Kokina, Kristina [Kollaborációs közreműködő]; Streikisa, Madara [Kollaborációs közreműködő]; Bartkevics, Vadims [Kollaborációs közreműködő]; Matar, Ghassan M. [Kollaborációs közreműködő]; Daoud, Ziad [Kollaborációs közreműködő]; Pereckienė, Asta [Kollaborációs közreműködő]; Butrimaite-Ambrozeviciene, Ceslova [Kollaborációs közreműködő]; Penny, Christian [Kollaborációs közreműködő]; Bastaraud, Alexandra [Kollaborációs közreműködő]; Rasolofoarison, Tiavina [Kollaborációs közreműködő]; Collard, Jean-Marc [Kollaborációs közreműködő]; Samison, Luc Hervé [Kollaborációs közreműködő]; Andrianarivelo, Mala Rakoto [Kollaborációs közreműködő]; Banda, Daniel Lawadi [Kollaborációs közreműködő]; Amin, Arshana [Kollaborációs közreműködő]; Rajandas, Heraa [Kollaborációs közreműködő]; Parimannan, Sivachandran [Kollaborációs közreműködő]; Spiteri, David [Kollaborációs közreműködő]; Haber, Malcolm Vella [Kollaborációs közreműködő]; Santchurn, Sunita J. [Kollaborációs közreműködő]; Vujacic, Aleksandar [Kollaborációs közreműködő]; Djurovic, Dijana [Kollaborációs közreműködő]; Bouchrif, Brahim [Kollaborációs közreműködő]; Karraouan, Bouchra [Kollaborációs közreműködő]; Vubil, Delfino Carlos [Kollaborációs közreműködő]; Pal, Pushkar [Kollaborációs közreműködő]; Schmitt, Heike [Kollaborációs közreműködő]; van Passel, Mark [Kollaborációs közreműködő]; Jeunen, Gert-Jan [Kollaborációs közreműködő]; Gemmell, Neil [Kollaborációs közreműködő]; Chambers, Stephen T. [Kollaborációs közreműködő]; Mendoza, Fania Perez [Kollaborációs közreműködő]; Huete-Pιrez, Jorge [Kollaborációs közreműködő]; Vilchez, Samuel [Kollaborációs közreműködő]; Ahmed, Akeem Olayiwola [Kollaborációs közreműködő]; Adisa, Ibrahim Raufu [Kollaborációs közreműködő]; Odetokun, Ismail Ayoade [Kollaborációs közreműködő]; Fashae, Kayode [Kollaborációs közreműködő]; Sørgaard, Anne-Marie [Kollaborációs közreműködő]; Wester, Astrid Louise [Kollaborációs közreműködő]; Ryrfors, Pia [Kollaborációs közreműködő]; Holmstad, Rune [Kollaborációs közreműködő]; Mohsin, Mashkoor [Kollaborációs közreműködő]; Hasan, Rumina [Kollaborációs közreműködő]; Shakoor, Sadia [Kollaborációs közreműködő]; Gustafson, Natalie Weiler [Kollaborációs közreműködő]; Schill, Claudia Huber [Kollaborációs közreműködő]; Rojas, Maria Luz Zamudio [Kollaborációs közreműködő]; Velasquez, Jorge Echevarria [Kollaborációs közreműködő]; Magtibay, Bonifacio B. [Kollaborációs közreműködő]; Catangcatang, Kris [Kollaborációs közreműködő]; Sibulo, Ruby [Kollaborációs közreműködő]; Yauce, Felipe Campos [Kollaborációs közreműködő]; Wasyl, Dariusz [Kollaborációs közreműködő]; Manaia, Celia [Kollaborációs közreműködő]; Rocha, Jaqueline [Kollaborációs közreműködő]; Martins, Jose [Kollaborációs közreműködő]; Álvaro, Pedro [Kollaborációs közreműködő]; Wen, Doris Di Yoong [Kollaborációs közreműködő]; Shin, Hanseob [Kollaborációs közreműködő]; Hur, Hor-Gil [Kollaborációs közreműködő]; Yoon, Sukhwan [Kollaborációs közreműködő]; Bosevska, Golubinka [Kollaborációs közreműködő]; Kochubovski, Mihail [Kollaborációs közreműködő]; Cojocaru, Radu [Kollaborációs közreműködő]; Burduniuc, Olga [Kollaborációs közreműködő]; Hong, Pei-Ying [Kollaborációs közreműködő]; Perry, Meghan Rose [Kollaborációs közreműködő]; Gassama, Amy [Kollaborációs közreműködő]; Radosavljevic, Vladimir [Kollaborációs közreműködő]; Tay, Moon Y. F. [Kollaborációs közreműködő]; Zuniga-Montanez, Rogelio [Kollaborációs közreműködő]; Wuertz, Stefan [Kollaborációs közreműködő]; Gavačová, Dagmar [Kollaborációs közreműködő]; Pastuchová, Katarína [Kollaborációs közreműködő]; Truska, Peter [Kollaborációs közreműködő]; Trkov, Marija [Kollaborációs közreműködő]; Keddy, Karen [Kollaborációs közreműködő]; Esterhuyse, Kerneels [Kollaborációs közreműködő]; Song, Min Joon [Kollaborációs közreműködő]; Quintela-Baluja, Marcos [Kollaborációs közreműködő]; Lopez, Mariano Gomez [Kollaborációs közreműködő]; Cerdà-Cuéllar, Marta [Kollaborációs közreműködő]; Perera, R. R. D. P. [Kollaborációs közreműködő]; Bandara, N. K. B. K. R. G. W. [Kollaborációs közreműködő]; Premasiri, H. I. [Kollaborációs közreműködő]; Pathirage, Sujatha [Kollaborációs közreműködő]; Charlemagne, Kareem [Kollaborációs közreműködő]; Rutgersson, Carolin [Kollaborációs közreműködő]; Norrgren, Leif [Kollaborációs közreműködő]; Örn, Stefan [Kollaborációs közreműködő]; Boss, Renate [Kollaborációs közreműködő]; Van, der Heijden Tanja [Kollaborációs közreműködő]; Hong, Yu-Ping [Kollaborációs közreműködő]; Kumburu, Happiness Houka [Kollaborációs közreműködő]; Mdegela, Robinson Hammerthon [Kollaborációs közreműködő]; Hounmanou, Yaovi Mahuton Gildas [Kollaborációs közreműködő]; Chonsin, Kaknokrat [Kollaborációs közreműködő]; Suthienkul, Orasa [Kollaborációs közreműködő]; Thamlikitkul, Visanu [Kollaborációs közreműködő]; Husman, Ana Maria de Roda [Kollaborációs közreműködő]; Bidjada, Bawimodom [Kollaborációs közreműködő]; Njanpop-Lafourcade, Berthe-Marie [Kollaborációs közreműködő]; Nikiema-Pessinaba, Somtinda Christelle [Kollaborációs közreműködő]; Levent, Belkis [Kollaborációs közreműködő]; Kurekci, Cemil [Kollaborációs közreműködő]; Ejobi, Francis [Kollaborációs közreműködő]; Kalule, John Bosco [Kollaborációs közreműködő]; Thomsen, Jens [Kollaborációs közreműködő]; Obaidi, Ouidiane [Kollaborációs közreműködő]; Jassim, Laila Mohamed [Kollaborációs közreműködő]; Moore, Andrew [Kollaborációs közreműködő]; Leonard, Anne [Kollaborációs közreműködő]; Graham, David W. [Kollaborációs közreműködő]; Bunce, Joshua T. [Kollaborációs közreműködő]; Zhang, Lihong [Kollaborációs közreműködő]; Gaze, William H. [Kollaborációs közreműködő]; Lefor, Brett [Kollaborációs közreműködő]; Capone, Drew [Kollaborációs közreműködő]; Sozzi, Emanuele [Kollaborációs közreműködő]; Brown, Joe [Kollaborációs közreműködő]; Meschke, John Scott [Kollaborációs közreműködő]; Sobsey, Mark D. [Kollaborációs közreműködő]; Davis, Michael [Kollaborációs közreműködő]; Beck, Nicola Koren [Kollaborációs közreműködő]; Sukapanpatharam, Pardi [Kollaborációs közreműködő]; Truong, Phuong [Kollaborációs közreműködő]; Lilienthal, Ronald [Kollaborációs közreműködő]; Kang, Sanghoon [Kollaborációs közreműködő]; Wittum, Thomas E. [Kollaborációs közreműködő]; Rigamonti, Natalia [Kollaborációs közreműködő]; Baklayan, Patricia [Kollaborációs közreműködő]; Van, Chinh Dang [Kollaborációs közreműködő]; Tran, Doan Minh Nguyen [Kollaborációs közreműködő]; Phuc, Nguyen Do [Kollaborációs közreműködő]; Kwenda, Geoffrey [Kollaborációs közreműködő]

Angol nyelvű Sokszerzős vagy csoportos szerzőségű szakcikk (Folyóiratcikk) Tudományos
Megjelent: NATURE COMMUNICATIONS 2041-1723 13 (1) Paper: 7251 , 16 p. 2022
  • Regionális Tudományok Bizottsága: A nemzetközi
  • SJR Scopus - Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous): D1
Azonosítók
Antimicrobial resistance (AMR) is a major threat to global health. Understanding the emergence, evolution, and transmission of individual antibiotic resistance genes (ARGs) is essential to develop sustainable strategies combatting this threat. Here, we use metagenomic sequencing to analyse ARGs in 757 sewage samples from 243 cities in 101 countries, collected from 2016 to 2019. We find regional patterns in resistomes, and these differ between subsets corresponding to drug classes and are partly driven by taxonomic variation. The genetic environments of 49 common ARGs are highly diverse, with most common ARGs carried by multiple distinct genomic contexts globally and sometimes on plasmids. Analysis of flanking sequence revealed ARG-specific patterns of dispersal limitation and global transmission. Our data furthermore suggest certain geographies are more prone to transmission events and should receive additional attention.
Hivatkozás stílusok: IEEEACMAPAChicagoHarvardCSLMásolásNyomtatás
2026-09-15 10:57