PhaSePro

Mészáros, Bálint [Mészáros, Bálint (Bioinformatika, b...), szerző] MTA-ELTE Lendület Bioinformatika Kutatócsoport (ELTE / TTK / Bio_I / Biokem_Tsz); Erdős, Gábor [Erdős, Gábor (Molekuláris biológia), szerző]; Szabó, Beáta [Szabó, Beáta (Molekuláris biológia), szerző] Enzimológiai Intézet (TTK); Schád, Éva [Schád, Éva (Szerkezeti biológia), szerző] Enzimológiai Intézet (TTK); Tantos, Ágnes [Tantos, Ágnes (Molekuláris Biológia), szerző] Enzimológiai Intézet (TTK); Abukhairan, Rawan [Horváth, Tamás (Enzimológia, Tomp...), szerző] Enzimológiai Intézet (TTK); Horváth, Tamás; Murvai, Nikoletta [Murvai, Nikoletta (Molekuláris biológia), szerző] Enzimológiai Intézet (TTK); Kovács, Orsolya P; Kovács, Márton; Tosatto, Silvio C E; Tompa, Péter [Tompa, Péter (Enzimológia), szerző] Enzimológiai Intézet (TTK); Dosztányi, Zsuzsanna [Dosztányi, Zsuzsanna (Fehérje szerkezet...), szerző] MTA-ELTE Lendület Bioinformatika Kutatócsoport (ELTE / TTK / Bio_I / Biokem_Tsz); Pancsa, Rita [Pancsa, Rita (Biológia), szerző] Enzimológiai Intézet (TTK)

Angol nyelvű Szakcikk (Folyóiratcikk) Tudományos
Megjelent: NUCLEIC ACIDS RESEARCH 0305-1048 1362-4962 48 (D1) pp. D360-D367 2020
  • SJR Scopus - Genetics: D1
Azonosítók
Membraneless organelles (MOs) are dynamic liquid condensates that host a variety of specific cellular processes, such as ribosome biogenesis or RNA degradation. MOs form through liquid-liquid phase separation (LLPS), a process that relies on multivalent weak interactions of the constituent proteins and other macromolecules. Since the first discoveries of certain proteins being able to drive LLPS, it emerged as a general mechanism for the effective organization of cellular space that is exploited in all kingdoms of life. While numerous experimental studies report novel cases, the computational identification of LLPS drivers is lagging behind, and many open questions remain about the sequence determinants, composition, regulation and biological relevance of the resulting condensates. Our limited ability to overcome these issues is largely due to the lack of a dedicated LLPS database. Therefore, here we introduce PhaSePro (https://phasepro.elte.hu), an openly accessible, comprehensive, manually curated database of experimentally validated LLPS driver proteins/protein regions. It not only provides a wealth of information on such systems, but improves the standardization of data by introducing novel LLPS-specific controlled vocabularies. PhaSePro can be accessed through an appealing, user-friendly interface and thus has definite potential to become the central resource in this dynamically developing field.
Hivatkozás stílusok: IEEEACMAPAChicagoHarvardCSLMásolásNyomtatás
2026-04-20 03:17