Neutral and positively charged new purine tetramer structures: a computational study of xanthine and uric acid derivatives

G, Paragi [Paragi, Gábor (molekulafizika, m...), szerző] MTA-SZTE Szupramolekuláris és Nanoszerkezetű An... (SZTE / ÁOK / OVI); L, Kovács [Kovács, Lajos (Nukleinsavak), szerző] Orvosi Vegytani Intézet (SZTE / ÁOK); Z, Kupihár [Kupihár, Zoltán (Szilárd fázisú sz...), szerző] Orvosi Vegytani Intézet (SZTE / ÁOK); J, Szolomájer [Szolomájer, János (Nukleinsavak), szerző] Orvosi Vegytani Intézet (SZTE / ÁOK); B, Penke [Penke, Botond (Neurodegeneráció,...), szerző] Orvosi Vegytani Intézet (SZTE / ÁOK); C, Fonseca Guerra; F M, Bickelhaupt

Angol nyelvű Tudományos Szakcikk (Folyóiratcikk)
Megjelent: NEW JOURNAL OF CHEMISTRY 1144-0546 1369-9261 35 pp. 119-126 2011
  • SJR Scopus - Chemistry (miscellaneous): Q1
Azonosítók
Szakterületek:
    New tetramer structures, based on 9-methylxanthine (Xa), 9-methylxanthine protonated at N7 (XaH+) and 9-methyluric acid (Ua), were investigated by high-level density functional calculations. We have found that homo- and heterotetrads (XaH+)4, (XaH+–Xa)2, (XaH+–Ua)2 carrying positive charges can be formed by low barrier hydrogen bonds. Systems with zero charge [(Xa)4, (Xa–Ua)2, (Ua)4] were also constructed, investigated and compared to the guanine tetrad [(G)4]. It was shown that the new tetramers can bind cations and anions without the necessity of stacking interactions. Application of the calculated systems in higher-ordered structures (e.g. quadruplexes) is promising with or without intercalating ions.
    Hivatkozás stílusok: IEEEACMAPAChicagoHarvardCSL
    2019-09-17 04:58